共50集
本剧根据金庸同名小说改编，讲述了出身卑微的韦小宝如何成长发迹并最终归隐的故事。出身市井、刁钻油滑的韦小宝因偶然知悉宫中秘密，冒充小太监入宫，助康熙擒获权臣鳌拜而成莫逆，又被天地会总舵主陈近南收为弟子，却因陈要其剌杀康熙，令其左右为难。小宝无意中得知康熙先帝顺治仍在世，而被派赴五台山探望，施妙计令康熙父子团聚；并力助康熙，出使云南，成功揭露吴三桂勾结外族和邪教图谋造反的阴谋，助康熙平定三藩，剿灭神龙教；既助罗刹国苏菲娅公主成功夺权，又击退罗刹国入侵，迫使其签下和约。屡立奇功的小宝被封一等鹿鼎公，受到众多红颜知己的青睐，尽享齐人之福。康熙在江山大统后命小宝剿灭天地会，忠义难两全的小宝无奈退隐江湖。
双儿哭着离开了天香楼，看着失魂落魄的韦小宝建宁狠狠的把他奚落了一顿。韦小宝见康熙回宫了，自己被师太掳走一事他还没想好怎么跟康熙交代，只觉得头大。韦小宝决定暂时先解决太后。
韦小宝带着师太和陶姑姑潜伏到慈宁宫中，他们刚隐藏好，建宁和太后就走了进来。建宁替太后把42章经从康熙那里偷了出来，她让太后想办法取消自己和吴应熊的婚事。太后三言两语打发走了建宁，师太跑出来与皇太后打斗起来，太后不是师太的对手，她使出化骨绵掌对付师太，反而被师太把化骨绵掌打到自己体内。师太欲取太后性命，谁知太后却说自己是个反清义士杀不得，她说自己这个太后是假冒的。
假太后告诉师太自己叫毛祖蓉，父亲毛成名是明朝的大将军，最后被清兵用反间计让袁崇焕大帅给误杀了。假太后说自己非常痛恨清兵，父亲死后自己被迫到皇宫里当了宫女侍候太后。她伺机迷晕了太后，弄了张假脸一直在后宫蒙混过关到现在。真的太后并没有死只是被自己关在慈宁宫内。
韦小宝发现42章经里有秘密，他破开42章经的封皮发现里面藏有地图的碎片，原来42章经内有藏宝图的传说是真的。韦小宝还让师太替自己解除了体内的化骨绵掌。
原来阿珂和阿琪都是师太的徒弟，阿琪姑娘与阿珂失散之后一直都没有出现。师太担心阿琪的安全，韦小宝告诉师太阿琪曾经和平西王府的总兵一起到过少林寺。师太决定带着韦小宝和阿珂一起到平西王府找阿琪。能够和阿珂这么美貌的女子在一起，韦小宝喜不自禁。
阿珂厌恶韦小宝到了极点，她让韦小宝早点离开否则自己就会杀了他。韦小宝死皮赖脸说自己要帮着师太找阿琪姑娘不肯离开，气得阿珂提着剑追着韦小宝满大街的跑。
师太遭到西域圣教尊者的袭击，两帮人激烈的打了起来。