共48集
京城突现夺心狂魔，频频作案杀人而后夺走心脏，杨宇轩奉命捉拿凶手，期间为保护朱一品不幸葬身火海。朱一品悲痛万分，发誓要为杨宇轩报仇。皇帝突发恶疾，面向全社会寻找神医，朱一品怀疑夺心狂魔就隐藏在宫闱之中，毅然揭下皇榜入宫。经过一番艰苦调查，朱一品发现太医郑载农就是夺心狂魔，可惜最终被他趁乱逃跑。朱一品在寻找郑载农的过程中发现了宁亲王意图谋反的狼子野心，为此他与医馆同僚们几次三番被卷入凶恶险境，但都凭借默契的合作和日益进步的推理能力一次次成功破案，同时也将宁亲王的阴谋一点点揭露。最终，他们深入敌穴，再一次成功阻止了宁亲王的谋反行动，守护住了国家的太平。
朱一品被当成嫌犯送到汉城监狱当卧底，一品看到监狱的情况后十分气愤想出去却失败了，一品的狱友出言提醒一品想在监狱存活的久就安静一点，一品猛然发现狱友竟然是自己卷轴中看到的被杀害的那个犯人。一品的狱友鸡腿欠了犯人小胖一两银子利息却是五百两，小胖来找鸡腿的茬，意在让鸡腿还钱，朱一品气不过出言帮助鸡腿，说出自己的名号却被小胖误认为一品是背后有强大的靠山害怕逃走，不料鸡腿非但不感激还提醒一品不要牵连自己。
陈安安醒来后气愤的喊众人来开会分配任务来拯救医馆，她让田田每天生产出一百片豆腐面膜，砺砺负责卖出全部的面膜，刘松负责各种脏活累活，柳若馨则负责发挥自己的优势招揽生意，自己则辅助柳若馨。
一品在狱中继续寻找赵瘦子和段英雄的上家，鸡腿再次提醒一品在狱中做到不该问的不问，不该说的不说。一品对鸡腿如此了解监狱生活而疑惑问其想不想早点被放出去，鸡腿却对一品的身份表示怀疑。正在两人交谈之际，狱中发生打架事件，一品看到其中一人身上有纹身刚想前去，被鸡腿阻止，他告诉一品这些都是监狱里黑白两道老大安排好的，打上一架新人里面有人想出头他们会记录下来借以招揽新人。一品主动为打架受伤的狱友治伤，众人甚为欣喜。柳若馨跟踪聂紫衣想找到一品的下落，无奈被紫衣发现，询问紫衣未果。一品为查案而决定接近张虎，不料张虎并不领情还让手下把一品拖走狂揍了一顿。狱友鸡腿询问一品是否要真的接近张虎得到准确答案后扬言要帮一品促成此事。鸡腿给一品分析监狱分为六个阶层:势、威、勇、力、能，最后一个就是像一品这种没有转职的废人，而与张虎并驾齐驱的另一个势就是名为赵寅的人，一品想要接近张虎就得成为前五个阶层的其中一种，他建议一品用自己大夫的本职晋升为能。一品主动为监狱众人看病获得众人的拥簇，小胖察觉出一品的谎言后再次来找一品茬向其讨账，一品借机给小胖看病想着为自己解围却未果，赵寅的心腹零风出现为其解困并想要拉拢一品去他们队伍，被一品拒绝后零风生气离去，鸡腿看到一品得罪了零风后恨铁不成钢。鸡腿暗中打伤张虎的助手，一品借看病之际与张虎套近乎。