共48集
京城突现夺心狂魔，频频作案杀人而后夺走心脏，杨宇轩奉命捉拿凶手，期间为保护朱一品不幸葬身火海。朱一品悲痛万分，发誓要为杨宇轩报仇。皇帝突发恶疾，面向全社会寻找神医，朱一品怀疑夺心狂魔就隐藏在宫闱之中，毅然揭下皇榜入宫。经过一番艰苦调查，朱一品发现太医郑载农就是夺心狂魔，可惜最终被他趁乱逃跑。朱一品在寻找郑载农的过程中发现了宁亲王意图谋反的狼子野心，为此他与医馆同僚们几次三番被卷入凶恶险境，但都凭借默契的合作和日益进步的推理能力一次次成功破案，同时也将宁亲王的阴谋一点点揭露。最终，他们深入敌穴，再一次成功阻止了宁亲王的谋反行动，守护住了国家的太平。
聂紫衣赶来将公公即将给皇上的药打翻,称药里有毒,皇帝不信。朱一品表示自己看了然仙师的药方确定有毒,皇帝以崔公公先行尝药未发生意外来证明药没有问题，一品请求皇帝容自己确定好药方在服用,被皇帝以询问然仙师意见拒绝。一品直言天底下有好多人想着杀皇帝，皇帝无奈只好让一品将剩下的药带回分析，但是太医院仍然制药十副，在制药期间，一品必须查出药方问题所在。紫衣趁机请求要审查崔公公，皇帝准许。
刘松赶回医馆与安安打闹，若馨表达对崔文西吃一品判定有毒的药没事的怀疑，一品表示可能崔文西吃的是一颗没事的丹药，聂紫衣推门而入哦，若馨不认同一品的推测，她认为在同一药罐中拿的药，且在众目睽睽之下调包可能性为0，一品对皇帝最近性情大变，宁愿试可能有毒的丹药，也不愿自己看他的眼疾表示疑惑，但是众人还是胸有成竹表示会勘破此案。
若馨偷偷潜入天牢找崔文西询问药有没有问题并威胁他，崔文西却迎面对上若馨的剑身亡，正在这时，然仙师带着官兵来围堵若馨，并命锦衣卫将其抓获，被紫衣赶来阻止。紫衣询问若馨得知崔文西死于她的剑下后，无奈只能秉公办案将其抓走。
刘松告知一品，若馨被锦衣卫带走了，一品惊慌失措。若馨等人被带到皇帝面前，皇上要处置若馨，朱一品连忙求情未果，一品只能请求与若馨同罪，皇帝将其发配向北流300里，并命其五年内不得回京，安安等人皆表示愿意同罪，皇帝竟然将全部人流放，并收回金字招牌。看到这一幕的宁王和然仙师内心狂喜。
皇帝再次服药之时，要宁王一同服下这所谓的大补好药，宁王推脱，一品等人赶回，原来先前的种种只是皇帝和一品等人演的一出戏。一品表示然仙师亲手制的药是毒药，因为在给崔文西尸检时，从身体里突然冒出一种特殊的蛊虫。被揭穿的然仙师欲逃跑，并招出杀不死的士兵吸引众人注意，一品保护遭遇偷袭的皇帝被迫误食丹药，然仙师掳走宁王。
一品想着自己把蛊虫逼出来未果，若馨等人想着用自己的办法，在此之前一品给众人留下一个锦囊命众人在其抗拒治疗时打开，然后就被喂了一大碗泻药，想着要其拉出蛊虫但也是未果。众人打开锦囊后，得出把蛊虫饿死的办法，众人当着一品的面大吃大喝未果。四个黑衣人连夜盗窃天和医馆的金字招牌，不料被招牌压倒，早上，众人发现金字招牌后面铁栓不见了。