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京城突现夺心狂魔，频频作案杀人而后夺走心脏，杨宇轩奉命捉拿凶手，期间为保护朱一品不幸葬身火海。朱一品悲痛万分，发誓要为杨宇轩报仇。皇帝突发恶疾，面向全社会寻找神医，朱一品怀疑夺心狂魔就隐藏在宫闱之中，毅然揭下皇榜入宫。经过一番艰苦调查，朱一品发现太医郑载农就是夺心狂魔，可惜最终被他趁乱逃跑。朱一品在寻找郑载农的过程中发现了宁亲王意图谋反的狼子野心，为此他与医馆同僚们几次三番被卷入凶恶险境，但都凭借默契的合作和日益进步的推理能力一次次成功破案，同时也将宁亲王的阴谋一点点揭露。最终，他们深入敌穴，再一次成功阻止了宁亲王的谋反行动，守护住了国家的太平。
尹大人并不相信一品的说辞，聂紫衣觉得案件必有蹊跷请求大人细审未果。众人无奈打道回府，途中朱一品突然头疼，众人只好在路边休息，柳若馨和刘松埋怨聂紫衣不靠谱办案质量没有保证，紫衣也无奈表示自己只能多接案子判案才能回到原来的位置。一品也诉说紫衣最近的乌龙事件让自己太丢人，紫衣却表示自己给医馆提供住的地方的条件就是一品众人帮忙判案。
何尚师向宁王控诉马也鹿想要篡权当同舟会的天师，宁王反驳他并同意马也鹿当天师，何上师这才明白是众人勾结在一起，他气愤的表示同舟会定会毁于众人手上然后转头欲离开，被进殿的百炼愁杀害。百炼愁向宁王报告朱一品并没有死只是住在一名锦衣卫家中，宁王表示这一次一定好好送他们一程。
朱一品捡起祖传兽医的本领想着赚点小钱补贴家用，陈安安见此十分心疼，朱一品则安慰安安说自己理解了当初安安的不容易，以后自己会养活众人。刘松前来叫为母牛难产看病的一品和安安吃饭，若馨特意做一大桌子菜来帮一品补身体，一品见此斥责若馨非常时期太过于铺张浪费，若馨说菜钱都是自己私房钱，自己愿意花与一品无关，一品则表示应当分清楚，自己身为男人应该靠自己手艺赚钱，若馨听闻十分生气捏碎一品用自己微薄工资买来的鸡蛋转头离去。一品扮成猪八戒来找若馨道歉，若馨被逗笑，两人正在为若馨在房间里找到的酸溜溜的诗争执之时，聂紫衣赶来，原来若馨生气跑进的房间是杨宇轩的房间，聂紫衣追忆雨轩之后，告诉二人有大案发生。
刘松也从东厂赶来跟随三人查案，聂紫衣将三人带到锦衣卫称这就是案发现场，原来是锦衣卫监视发现同舟会一直在有意的向社会栋梁中间渗透，吸收他们为自己卖命，偏偏这些人位高权重，影响很大，也容易动摇大明的根基。他们想与其坐以待毙，不如主动出击提前对这些有能力的人进行监视，然后建立数据库让先知分析数据，把有叛变想法的人提前抓起来。现在先知被杀了，凶手杀人后偷走了一份资料，三人还有陈慕禅皆在被盗走的嫌疑人名单之中，现在通缉令已经下来了，全城锦衣卫都在捉拿四人，三人听闻赶紧逃跑，不料半路遇到黑衣人追杀，黑衣人对其招招毙命，朱一品分析得出黑衣人不是锦衣卫的人。
一品晕倒，陈慕禅及时赶来喂一品吃了稳定剂，锦衣卫的人追来，若馨只能带四人去西厂躲避，安安和胡砺金也被紫衣带回西厂。若馨被自己的义父西厂的厂长叫去谈话，刘松向若馨报告一品醒来，并且表明发生了与先知谋杀案有关的另一凶杀案。若馨和刘松决定独自前往打探情况，若馨发现死的人不是先知，刘松发现尸体竟然是陈永仁，锦衣卫的人赶来，二人只好打道回府，途中偶遇假扮算命先生的陈慕禅，陈慕禅告诉二人西厂被锦衣卫占了，安安已经将一品转移了。