共66集
唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，在助其自救后，发现他是断案奇才。适逢皇上派他去感业寺查案，遂决定带狄仁杰一同前往。在感业寺，狄仁杰侦破奇案，化解了一场佛门大劫，并与武媚娘结缘。狄仁杰一鸣惊人，被皇上派往并州，在此期间，他屡破奇案，被称为神判。时有前朝鬼兵杀人事件，狄仁杰前去查看，发现与前朝宝藏及濮王李泰意图造反有关，却被毁灭证据，无法继续。此时，发生武媚娘杀害亲女，嫁祸王皇后之事，皇上召狄仁杰回长安调查。根据武媚娘提供的线索，狄仁杰破获此案，并在李泰的住所找到前朝宝藏，成为濮王谋反的确实证据。而狄仁杰也知道此前破案过程中每遇瓶颈时为他解惑的人竟是武媚娘，只觉武媚娘深不可测，野心更是超乎自己的想象。果然不久，唐高宗因风疾发作，让武媚娘一同上朝，合称二圣临朝。电视剧《通天狄仁杰》正在热播，讲述的是唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，发现他是断案奇才后被委以重任，在好搭档墨雨的协助下开始侦破一桩桩奇案的故事。剧中阚清子饰演的慕容清经历十分坎坷，而且身份不简单。刚开始的时候，狄仁杰一直都在破案，而武则天也从旁协助她，曾几何时，狄仁杰确实是对武则天，也就是民间的武媚娘动心过了的，但是慢慢地随着事情的一步步发展，他发现这个女人很有野心，也很有心计，远远不是自己所能够掌控的，而且她所显露出来的本事也注定了他们两个不能够相爱，之后又看到了武则天怀上了李治的孩子，所以更不可能在一起了。或许两个人有过好感，想要喜欢彼此，但是两个人的性格和内心决定了他们不能够走到一起。最后从历史上面看，两个人是好友，武则天一直很信任狄仁杰，有什么事情都会找他求助。是知己是好友。到底爱不爱，或许，只有他们自己知道了。
狄仁杰对大家道出了原委，而且，王昭燕的秘密情人应该会在通风口处守候，准备散发“捏死我的温柔”，所以，大家一定要严格防范找出此人，然后，狄仁杰和武媚娘进入普世殿，准备寻找宝藏的线索。他们意识到，想要找到秘密，就要先把一切恢复原状，武媚娘已经在此住了三年，在她的帮助下，狄仁杰把书架们一一摆正。另一边，慕容清和墨雨遵循狄仁杰的安排，准备护送阎立本进宫面圣。
经过深思熟虑，阎立本准备分头行动，他独自进入皇宫，墨雨去找放毒的人，慕容清去及时救助狄仁杰。没想到，阎立本刚刚来到宫门口，就意外撞见了皇后娘娘，皇后准备去监刑，阎立本自知不妙，得赶紧找到皇上。而墨雨那边也不太顺利，他意识到今晚是东风，神秘人肯定在城东放毒，但城东的范围实在太大了，到底该怎么寻找呢？另一边，慕容清来到药房，给狄仁杰抓药，没想到药房掌柜却是王昭燕假扮的，王昭燕声称要报恩，然后一把打晕了慕容清。
在普世殿里，一切装置都已经恢复原位，可狄仁杰此时却有些心神不定，因为整个长安城百姓的生死都寄托在他身上，所以狄仁杰倍感压力重大，他险些自乱阵脚，多亏武媚娘狠狠扇了狄仁杰一巴掌，把他打醒，然后，武媚娘冒险拔出了狄仁杰后脑的银针，令狄仁杰终于心静下来，开始认真在殿内查找线索，但如此一来，狄仁杰必定会过分耗费体力，并且加速死亡，可现在他也顾不了那么多了，必须赶紧解开“春雨绵绵妻独宿”的秘密。
阎立本费尽心机才见到皇上，赶紧禀告皇上，皇后准备置武媚娘于死地，正在前往感业寺监刑的路上！皇上很是伤心，可却拿皇后没有办法，阎立本忠心耿耿，他向皇上推荐了狄仁杰，并提了一个问题：皇上是否爱武媚娘？如果爱，皇上就应该跟着阎立本去救武媚娘一命。
在普世殿内，狄仁杰觉得观音像十分眼熟，但却想不出来有哪里不对，突然间，他的脑中灵光乍现，发觉观音像与王昭燕十分相像！这时，蒋昊辰无奈地走进来，皇后已经来到感业寺，蒋昊辰不得不带着武媚娘出去。狄仁杰心急如焚，他仍想救武媚娘一命，可却心有余而力不足，最后，蒋昊辰带走了武媚娘，留下狄仁杰一人在普世殿内找线索。
皇后一见到武媚娘，就大动肝火，质问她是否怀有孽种，武媚娘沉默不答话，皇后便命令蒋昊辰将武媚娘推上火堆，将她烧成飞灰。武媚娘十分从容地走上刑架，并不惧怕。另一边，王昭燕把捏死我的温柔放进了解铃还须系铃人里面，给慕容清穿上，如果狄仁杰没有按时找到“春雨绵绵妻独宿”的秘密，慕容清就会死于非命。