共66集
唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，在助其自救后，发现他是断案奇才。适逢皇上派他去感业寺查案，遂决定带狄仁杰一同前往。在感业寺，狄仁杰侦破奇案，化解了一场佛门大劫，并与武媚娘结缘。狄仁杰一鸣惊人，被皇上派往并州，在此期间，他屡破奇案，被称为神判。时有前朝鬼兵杀人事件，狄仁杰前去查看，发现与前朝宝藏及濮王李泰意图造反有关，却被毁灭证据，无法继续。此时，发生武媚娘杀害亲女，嫁祸王皇后之事，皇上召狄仁杰回长安调查。根据武媚娘提供的线索，狄仁杰破获此案，并在李泰的住所找到前朝宝藏，成为濮王谋反的确实证据。而狄仁杰也知道此前破案过程中每遇瓶颈时为他解惑的人竟是武媚娘，只觉武媚娘深不可测，野心更是超乎自己的想象。果然不久，唐高宗因风疾发作，让武媚娘一同上朝，合称二圣临朝。电视剧《通天狄仁杰》正在热播，讲述的是唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，发现他是断案奇才后被委以重任，在好搭档墨雨的协助下开始侦破一桩桩奇案的故事。剧中阚清子饰演的慕容清经历十分坎坷，而且身份不简单。刚开始的时候，狄仁杰一直都在破案，而武则天也从旁协助她，曾几何时，狄仁杰确实是对武则天，也就是民间的武媚娘动心过了的，但是慢慢地随着事情的一步步发展，他发现这个女人很有野心，也很有心计，远远不是自己所能够掌控的，而且她所显露出来的本事也注定了他们两个不能够相爱，之后又看到了武则天怀上了李治的孩子，所以更不可能在一起了。或许两个人有过好感，想要喜欢彼此，但是两个人的性格和内心决定了他们不能够走到一起。最后从历史上面看，两个人是好友，武则天一直很信任狄仁杰，有什么事情都会找他求助。是知己是好友。到底爱不爱，或许，只有他们自己知道了。
如今，可怜的蓝绫被冤枉成了凶手，只见她与大当家的尸体待在同一个亭子里，此情此景，要说蓝绫不是凶手，恐怕真没有人相信。狄仁杰相信蓝绫一定是无辜的，他愿意听其解释，蓝绫描述道，自己早上在凉亭里碰巧看见了大当家荆无形，他当时正在等人，自己便上前寒暄几句离开，没想到刚走没几步，荆无形就被鱼肠剑穿心而亡，而蓝绫却连凶手的影子都没看见！正当大家一筹莫展之际，朝廷又传来旨意，皇上命令狄仁杰在三日内查出黑风寨真凶！此时，狄仁杰可谓任重而道远，他不仅要抓到心狠手辣的凶手，更要为蓝绫洗脱冤屈。
让人意外的是，狄仁杰下令将蓝绫关进阁楼，红巾焦急地为姐姐求情，但狄仁杰坚持己见，蓝绫只好乖乖走进阁楼。其实，狄仁杰这么做，是为了撇清干系，让大家信服，只有这样，狄仁杰才能在众目睽睽之下找到证据，抓到元凶。正当焦头烂额时，狄仁杰从儿童拿着的糖人得到了灵感，察觉到了破案的关键。
于是，狄仁杰认真地观察剑鞘，发现里面有一些蜡屑，他恍然大悟，赶紧召集黑风寨众人，说出了心中的推测。其实，当日大家在武殿看见的三把宝剑，只不过是剑鞘，凶手用蜡雕做成了剑柄，以此迷惑了众人，而里面真正的宝剑，早就被凶手偷走了！而那场处心积虑的大火，其实是要让剑柄融化，消灭作案证据，那么，盗剑的人肯定在参观武殿的众人之中！
做三把蜡雕，不是一时半会就能完成的事情，这凶手很有可能就是黑风寨的自己人。狄仁杰认为，当务之急是找到做蜡雕的人，顺藤摸瓜，才能找到凶手。于是，狄仁杰带着墨雨和红巾去找濮王殿下，希望能从见多识广的濮王口中探知一二。红巾心中不免有气，她认为狄仁杰完全是在以公谋私，来偷偷见慕容清，墨雨感慨道，正因为慕容清身上有一种扑朔迷离的神秘感，才会让男人心驰神往。
狄仁杰打听到，有如此高超蜡雕技艺的人叫鬼斧神七，但此人据说性情古怪，一言不合就拔刀相向。狄仁杰没有畏惧，他找到鬼斧神七，发现这是一个双眼失明的老工匠前辈，房间里摆满了纸张和蜡做成的物件，一个个精美绝伦，可以以假乱真。
然后，狄仁杰把宝剑交给鬼斧神七，想询问他是否替人做过这种剑，老工匠摸了摸剑柄，他的表情逐渐变得严肃，对于狄仁杰的询问闭口不答。鬼斧神七曾经立下规矩，不会透露客人的任何隐私，他只做生意，不言其他。狄仁杰无奈之下，只好告诉老工匠，有坏人利用了他的技艺，瞒天过海杀人不眨眼，鬼斧神七这才答应透露线索。
可是，当鬼斧神七听说了狄仁杰是官府中人时，他顿时变得愤懑，严词拒绝了狄仁杰的任何请求，因为老工匠的家人就是被官府害死的，他的眼睛也是因此失明，可以说，老工匠与官府的仇恨似海深！狄仁杰一心为民，他不惜跪在了鬼斧神七面前，宁愿辞官，也要挽救黑风寨三百多条性命。
鬼斧神七拗不过狄仁杰的决心，他吟诵出了一首诗：“咫尺江山小亦大，须臾富贵有还无，日月楼台起妆处，仁人应与佞人殊”，这里面包含了老工匠知道的所有信息，但是还需要狄仁杰仔细钻研，认真参透其中奥妙。狄仁杰再三谢过老前辈，心满意足地离开。
另一边，墨雨和红巾陪着被关禁闭的蓝绫谈心，忽然发现窗外闪过一个人影，原来是伶人冷月，冷月身份可怜，是个无依无靠的孤儿，红巾便热情