共66集
唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，在助其自救后，发现他是断案奇才。适逢皇上派他去感业寺查案，遂决定带狄仁杰一同前往。在感业寺，狄仁杰侦破奇案，化解了一场佛门大劫，并与武媚娘结缘。狄仁杰一鸣惊人，被皇上派往并州，在此期间，他屡破奇案，被称为神判。时有前朝鬼兵杀人事件，狄仁杰前去查看，发现与前朝宝藏及濮王李泰意图造反有关，却被毁灭证据，无法继续。此时，发生武媚娘杀害亲女，嫁祸王皇后之事，皇上召狄仁杰回长安调查。根据武媚娘提供的线索，狄仁杰破获此案，并在李泰的住所找到前朝宝藏，成为濮王谋反的确实证据。而狄仁杰也知道此前破案过程中每遇瓶颈时为他解惑的人竟是武媚娘，只觉武媚娘深不可测，野心更是超乎自己的想象。果然不久，唐高宗因风疾发作，让武媚娘一同上朝，合称二圣临朝。电视剧《通天狄仁杰》正在热播，讲述的是唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，发现他是断案奇才后被委以重任，在好搭档墨雨的协助下开始侦破一桩桩奇案的故事。剧中阚清子饰演的慕容清经历十分坎坷，而且身份不简单。刚开始的时候，狄仁杰一直都在破案，而武则天也从旁协助她，曾几何时，狄仁杰确实是对武则天，也就是民间的武媚娘动心过了的，但是慢慢地随着事情的一步步发展，他发现这个女人很有野心，也很有心计，远远不是自己所能够掌控的，而且她所显露出来的本事也注定了他们两个不能够相爱，之后又看到了武则天怀上了李治的孩子，所以更不可能在一起了。或许两个人有过好感，想要喜欢彼此，但是两个人的性格和内心决定了他们不能够走到一起。最后从历史上面看，两个人是好友，武则天一直很信任狄仁杰，有什么事情都会找他求助。是知己是好友。到底爱不爱，或许，只有他们自己知道了。
独路林是一片阴森可怕的小树林，每到夜间冷风阵阵，千万树影如同鬼魅一般，据说大力神将军的尸骸就压在这树林中的石敢当石碑下面。这天，两个士兵醉醺醺地从这里路过，他们的胆子倒是很大，竟然在将军的墓碑前撒野，突然之间，石碑炸裂，一个戴着面具的黑衣人腾云驾雾般出现，一把拧断了士兵的脖子，一时间人心惶惶，大家都认为独路林的石敢当在闹鬼，人云亦云，传得十分可怕。
在狄仁杰府中，墨雨在无微不至地照顾着蓝绫，已经过去三个月了，可蓝绫的眼睛还是睁不开，狄仁杰便从民间寻来了以毒攻毒的偏方，但未经验证，谁也不能保证这药能保蓝绫平安。关键时刻，墨雨为了替蓝绫试药，不惜身中剧毒，多亏狄仁杰和红巾及时赶到，将萝卜碾碎，喂他服下，这才侥幸保住了墨雨的一条性命。而蓝绫听到墨雨痛苦的呻吟声，不由得心中大为感动。
狄仁杰笑眯眯地看着墨雨，他心中感慨颇多，墨雨已经服侍了自己十年，如今也到了成家立业的年龄，所以，狄仁杰称不会绊住墨雨的脚步，反而支持他去寻找不一样的人生。墨雨只是坦然地笑了笑，他心甘情愿地跟随狄仁杰，不会离开，如今唯一的心愿就是让蓝绫重见光明。看见狄仁杰束手无策，墨雨低声道，若是慕容清在就好了。狄仁杰又何尝不知道慕容清的医术高明，但两人之间已经闹得不可开交，怎么还能去求慕容清为蓝绫医治眼睛呢？
此时此刻，慕容清正在为皇上按摩头部，皇上对慕容清的手法大加赞扬，称赞她是难得的医女。两人在谈话中谈及濮王，皇上的脸上露出了为难之色，他始终对自己没有尽到兄长责任感到惭愧，然后，皇上吩咐慕容清去探望再次怀孕的武媚娘。当慕容清寻到武媚娘时，她正在被皇后刁难，慕容清赶紧搬出皇上做挡箭牌，使皇后不得不气呼呼地离开。
慕容清为武媚娘把脉，发现胎儿很健康，但武媚娘这个母体却是肝火郁结。武媚娘叹了口气，皇后逼迫自己离开这座居住许久的寝殿，要将自己赶去凤琴殿，而那里据说风水犯了天罗煞，经常无缘无故死人，这该如何是好呢？慕容清听说此事，很为柔弱的武媚娘抱不平，不知她为何不去求皇上做主。武媚娘眼帘微垂，后宫以皇后为尊，自己小小一个昭仪又能奈何，反正凤琴殿很是清净，搬过去也好。
慕容清告别武媚娘后，从一个公公手中拿到了李泰写的纸条，她打开看后，一脸凝重。另一边，狄仁杰受县令所托，调查独路林的命案。四十年前，汴州城外的独路林曾经发生了一场惨烈的激战，一个前朝的将军带着十二名士兵被大唐军队围捕，最后全部死在独路林内，现在，大家传闻这位将军带着十二名士兵破开了鬼门关，已经回到了独路林，准备血债血偿。
于是，狄仁杰跟随县令去独路林查看线索，他认为，凶手是故意放出鬼将军回魂消息的，以此来迷惑人心。而令人惊喜的是，狄仁杰在汴州军中看见了黑风寨的三当家凌霄牧，原来，他已经被收编到了朝廷军队中，据他所说，有几名士兵在独路林得了传染病，大家都传闻是鬼将军所为，狄仁杰准备去探望感染疫症的士兵，不料正好遇见在此奉旨诊病的慕容清，二人面面相觑。慕容清已经查出，这些士兵是中了瘴气，但是这种瘴毒一般来说不应该传染，不知他们为何会互相感染。