共66集
唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，在助其自救后，发现他是断案奇才。适逢皇上派他去感业寺查案，遂决定带狄仁杰一同前往。在感业寺，狄仁杰侦破奇案，化解了一场佛门大劫，并与武媚娘结缘。狄仁杰一鸣惊人，被皇上派往并州，在此期间，他屡破奇案，被称为神判。时有前朝鬼兵杀人事件，狄仁杰前去查看，发现与前朝宝藏及濮王李泰意图造反有关，却被毁灭证据，无法继续。此时，发生武媚娘杀害亲女，嫁祸王皇后之事，皇上召狄仁杰回长安调查。根据武媚娘提供的线索，狄仁杰破获此案，并在李泰的住所找到前朝宝藏，成为濮王谋反的确实证据。而狄仁杰也知道此前破案过程中每遇瓶颈时为他解惑的人竟是武媚娘，只觉武媚娘深不可测，野心更是超乎自己的想象。果然不久，唐高宗因风疾发作，让武媚娘一同上朝，合称二圣临朝。电视剧《通天狄仁杰》正在热播，讲述的是唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，发现他是断案奇才后被委以重任，在好搭档墨雨的协助下开始侦破一桩桩奇案的故事。剧中阚清子饰演的慕容清经历十分坎坷，而且身份不简单。刚开始的时候，狄仁杰一直都在破案，而武则天也从旁协助她，曾几何时，狄仁杰确实是对武则天，也就是民间的武媚娘动心过了的，但是慢慢地随着事情的一步步发展，他发现这个女人很有野心，也很有心计，远远不是自己所能够掌控的，而且她所显露出来的本事也注定了他们两个不能够相爱，之后又看到了武则天怀上了李治的孩子，所以更不可能在一起了。或许两个人有过好感，想要喜欢彼此，但是两个人的性格和内心决定了他们不能够走到一起。最后从历史上面看，两个人是好友，武则天一直很信任狄仁杰，有什么事情都会找他求助。是知己是好友。到底爱不爱，或许，只有他们自己知道了。
狄仁杰坚信武媚娘不是凶手，他其实已经猜出了孩子的爹是谁，但是却故意缄默不肯说出心中所想。这时，王浩德独自一人来到狄仁杰身边，他说出了自己的心里话，原来，王浩德知道此案牵涉极广，害怕狄仁杰有危险。万不得已下，狄仁杰只好答应王浩德，一旦有生命危险，自己会马上抽身而退，不再调查。看来，王浩德一定知晓关于此案的重要秘密，甚至是关系到人命的秘密。
狄仁杰来寻找慕容清，他回忆起三年前与慕容清在一起的情景，两人情投意合，一起练功，一起把酒言欢，十分甜蜜，慕容清也十分真诚地表达了对自己的爱慕之情，狄仁杰至今都无法忘记，慕容清紧紧抓住自己的手，眼中泛起晶莹的泪花，希望自己能陪她一起笑傲江湖。然而，就在慕容清表白后的第二天，狄仁杰就突然消失了，令慕容清伤心不已。
狄仁杰从回忆里走出来，正准备去见慕容清，忽然传来消息，王浩德出事了！于是，狄仁杰顾不得慕容清，赶紧掉头去看望王浩德。原来，王浩德向武媚娘借了普世殿的钥匙，一个人进去搜查，没想到一个时辰过去了，他还没有出来，众人前去敲门时，发现门已经被反锁，便赶紧通知狄仁杰。
蒋昊辰与狄仁杰等人闯入普世殿，发现里面的书架全部倒塌，而殿外守卫的士兵们都咳嗽不止，双手紧紧卡住脖颈，状态与死去的方太极极为相像，蒋昊辰负责解救士兵们，而狄仁杰负责去殿内寻找王浩德。
狄仁杰发现王浩德受了重伤，他无法医治，赶紧去寻找慕容清帮忙，慕容清用用悬丝神针保住了王浩德的性命，却解不了毒。据狄仁杰所说，自己在殿内发现王浩德时，他近乎疯狂地用双手死死卡住脖子，怎么也掰不开，于是，狄仁杰无奈之下，只能让墨雨挥剑砍断了王浩德的双手，这才保住了他的性命。而那些殿外的士兵们则没那么好运了，纷纷惨死。
蒋昊辰询问慕容清，是否相信人会掐死自己？慕容清给出了否定的答案，狄仁杰坚定地说，自己一定会揪出凶手，让案情水落石出。慕容清检查了士兵们的尸体，发现他们的确是窒息身亡，慕容清拿出了自家的秘方——青山绿水，只要用这种药水检验，若是血液中有毒，秘方的液体就会变成绿色，毒性越强，颜色越深。
狄仁杰拿来一只白瓷碗，将青山绿水倒在里面，经过检验，发现毒性轻微，那凶手到底是怎么下的毒呢？大家一起向武媚娘求解，武媚娘称昨夜自己一直都在房中，王浩德前来借钥匙，自己便借给了他。蒋昊辰怀疑武媚娘仍有最大嫌疑，可狄仁杰认为她没有杀人动机，蒋昊辰指出，也许武媚娘正是害怕王浩德在殿内查出什么线索，才痛下杀手。
狄仁杰坚持为武媚娘伸冤，慕容清则认为，武媚娘就算不是凶手，也肯定不是个普通女人，她的最厉害之处就是把初次见面的狄仁杰收为己用。话里话外，慕容清在吃醋而已。