共66集
唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，在助其自救后，发现他是断案奇才。适逢皇上派他去感业寺查案，遂决定带狄仁杰一同前往。在感业寺，狄仁杰侦破奇案，化解了一场佛门大劫，并与武媚娘结缘。狄仁杰一鸣惊人，被皇上派往并州，在此期间，他屡破奇案，被称为神判。时有前朝鬼兵杀人事件，狄仁杰前去查看，发现与前朝宝藏及濮王李泰意图造反有关，却被毁灭证据，无法继续。此时，发生武媚娘杀害亲女，嫁祸王皇后之事，皇上召狄仁杰回长安调查。根据武媚娘提供的线索，狄仁杰破获此案，并在李泰的住所找到前朝宝藏，成为濮王谋反的确实证据。而狄仁杰也知道此前破案过程中每遇瓶颈时为他解惑的人竟是武媚娘，只觉武媚娘深不可测，野心更是超乎自己的想象。果然不久，唐高宗因风疾发作，让武媚娘一同上朝，合称二圣临朝。电视剧《通天狄仁杰》正在热播，讲述的是唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，发现他是断案奇才后被委以重任，在好搭档墨雨的协助下开始侦破一桩桩奇案的故事。剧中阚清子饰演的慕容清经历十分坎坷，而且身份不简单。刚开始的时候，狄仁杰一直都在破案，而武则天也从旁协助她，曾几何时，狄仁杰确实是对武则天，也就是民间的武媚娘动心过了的，但是慢慢地随着事情的一步步发展，他发现这个女人很有野心，也很有心计，远远不是自己所能够掌控的，而且她所显露出来的本事也注定了他们两个不能够相爱，之后又看到了武则天怀上了李治的孩子，所以更不可能在一起了。或许两个人有过好感，想要喜欢彼此，但是两个人的性格和内心决定了他们不能够走到一起。最后从历史上面看，两个人是好友，武则天一直很信任狄仁杰，有什么事情都会找他求助。是知己是好友。到底爱不爱，或许，只有他们自己知道了。
狄仁杰仔仔细细地听着武媚娘的一言一语，他发觉其中大有文章，于是，不入虎穴焉得虎子，狄仁杰准备拜托武媚娘一件大事，他准备偷偷潜入宫中！红巾大吃一惊，现在到处都在通缉狄仁杰，他岂不是自投罗网吗？可狄仁杰却不这么认为，最危险的地方也就是最安全的地方，值得冒险！于是，武媚娘用大箱子将狄仁杰主仆三人运输到殿内，等候时机行动。
武媚娘故意将皇上请到自己殿中，举起酒杯，千娇百媚地劝酒，但是，皇上却不为所动，还冷冰冰地置武媚娘于不顾，言语中只谈及长孙无忌的种种举动，甚至对武媚娘许诺，只要共同努力除掉长孙无忌，就封武媚娘做皇后！狄仁杰躲在暗处，看得一清二楚，他心中疑云密布，皇上为何突然像换了一个人呢？幸亏武媚娘机智，反应灵活，这才对答如流，但皇上说什么也不肯在此留宿，执意离开。
现在，就连红巾都能看得出来，皇上对武媚娘的感情大不如前，武媚娘也不明白为什么，她甚至有一种预感，等到皇上除掉长孙无忌后，下一个便要对付自己了。狄仁杰眉头紧蹙，皇上的行事风格虽然有了巨变，但好似并不陌生。
皇上从武媚娘处拿到了长孙无忌写给储大人的信，可储大人乃是罪臣，皇上借题发挥，责怪长孙无忌私下里与罪臣联系，是图谋不轨，对天子的判决不满！于是，皇上一怒之下，削去了长孙无忌的太尉一职，命他回老家养老。长孙无忌无话可说，只能领命谢恩。而后，皇上做出了一个更惊人的决定，他称自己性命垂危，准备把皇位让给濮王！
大臣们纷纷劝谏，可皇上的意思很是坚决，谁也无法撼动。狄仁杰等人听闻这个消息，也是大吃一惊，狄仁杰回想起事发前的种种，他得出了一个大胆的结论：在芙蓉园被自己杀死的濮王是假扮的，而后来活过来的濮王也是假的，真正的濮王是如今在宫中的皇上！皇上就是濮王假扮的，蒋昊辰不过是个替死鬼，濮王先用潜龙王的身份作案，一步步地铺路，等到潜龙王再无可利用的价值，濮王就把这个身份给终结了，假扮皇上，顺理成章禅让皇位，达到狼子野心的目的！
如今，当务之急是救出皇上，揭穿濮王的真面目，狄仁杰秘密派人暗中监视皇上的一举一动。赵统领及时向武媚娘汇报皇上的一举一动，传达了一句“夜泊枫桥，明日即亡”的暗语，狄仁杰百般思索，猜出皇上被关在药王山庄的梦月小楼！事不宜迟，狄仁杰妥善安排人手，先秘密捉拿慕容清，他希望慕容清毫发无损，更希望自己不要和慕容清当面针锋相对。
武媚娘成功捉到慕容清，她苦口婆心地劝告这个女子，现在狄仁杰正在风口浪尖，没有什么比一个真心爱人更珍贵，希望慕容清能够想通。另一边，慕容山庄的人发现了狄仁杰的行踪，可却意外收到了慕容清的命令：命所有人等撤回山庄！没办法，慕容山庄的人只好听从慕容清指挥，而狄仁杰已经赶到了梦月小楼，在里面发现了被绑的皇上，而一场大战也在所难免。