共66集
唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，在助其自救后，发现他是断案奇才。适逢皇上派他去感业寺查案，遂决定带狄仁杰一同前往。在感业寺，狄仁杰侦破奇案，化解了一场佛门大劫，并与武媚娘结缘。狄仁杰一鸣惊人，被皇上派往并州，在此期间，他屡破奇案，被称为神判。时有前朝鬼兵杀人事件，狄仁杰前去查看，发现与前朝宝藏及濮王李泰意图造反有关，却被毁灭证据，无法继续。此时，发生武媚娘杀害亲女，嫁祸王皇后之事，皇上召狄仁杰回长安调查。根据武媚娘提供的线索，狄仁杰破获此案，并在李泰的住所找到前朝宝藏，成为濮王谋反的确实证据。而狄仁杰也知道此前破案过程中每遇瓶颈时为他解惑的人竟是武媚娘，只觉武媚娘深不可测，野心更是超乎自己的想象。果然不久，唐高宗因风疾发作，让武媚娘一同上朝，合称二圣临朝。电视剧《通天狄仁杰》正在热播，讲述的是唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，发现他是断案奇才后被委以重任，在好搭档墨雨的协助下开始侦破一桩桩奇案的故事。剧中阚清子饰演的慕容清经历十分坎坷，而且身份不简单。刚开始的时候，狄仁杰一直都在破案，而武则天也从旁协助她，曾几何时，狄仁杰确实是对武则天，也就是民间的武媚娘动心过了的，但是慢慢地随着事情的一步步发展，他发现这个女人很有野心，也很有心计，远远不是自己所能够掌控的，而且她所显露出来的本事也注定了他们两个不能够相爱，之后又看到了武则天怀上了李治的孩子，所以更不可能在一起了。或许两个人有过好感，想要喜欢彼此，但是两个人的性格和内心决定了他们不能够走到一起。最后从历史上面看，两个人是好友，武则天一直很信任狄仁杰，有什么事情都会找他求助。是知己是好友。到底爱不爱，或许，只有他们自己知道了。
又是看似风平浪静的一天，武媚娘在殿中仔细照顾着孩童，狄仁杰带着墨雨等人前来拜访，红巾见到武媚娘忍气吞声地住在破旧冷清的殿中，不由得为她打抱不平，武媚娘也很无奈，这是王皇后的安排，自己又能怎样呢？据传闻，在这凤琴殿中曾经住着一位徐婕妤，被先帝冷落成为弃妃而上吊自杀，每当武媚娘想起此事就心神不定，甚至言语无状。
狄仁杰为她诊断后，发现她肝气郁结，如果长久下去可能会患上离梦症，郁郁寡欢导致喜怒无常。皇上听说此事后，大吃一惊，自然想赶紧医治美人，狄仁杰顺便说出凤琴殿阴暗湿冷，不适合居住，皇上思考了片刻，让尚宫局给武媚娘送去了上好的炭火，加强守卫，务必要让武媚娘住得安心。
可是，当武媚娘看见宫外的重重守卫时，更加心神不宁，总觉得有人要加害自己，甚至连连向皇上苦求，称自己听见了徐婕妤鬼魂的哭声！皇上被她吓得不轻，只觉得武媚娘已经疯癫了，赶紧逃走。另一边，萧淑妃对皇上是殷勤备至，她见皇上为了武媚娘的事情烦心，便建议皇上带着武媚娘去踏青散心，使得皇上认为萧淑妃是一个难得的贤妃。
王皇后听说武媚娘神志恍惚，十分得意，她在暗中求得道长相助，希望能置武媚娘于死地。于是，这个心狠手辣的女人决定向无辜的婴孩下手！另一边，狄仁杰与墨雨、红巾正在商讨如何对付潜龙王，正当他们筹谋划策时，突然惊闻一个消息：小公主被人杀死了！狄仁杰大惊失色，赶紧匆匆而来，只见武媚娘哭得十分凄惨，哭诉着公主被人掐死的惨状。
赵宝将军告诉狄仁杰，午后皇上与武媚娘出去散心，只留小公主在殿内，王皇后曾经来过一次，摸了摸小公主的脖颈，便离开了，但就在不久后，当武媚娘回到寝殿，却发现小公主已经身亡！因为只有皇后来过凤琴殿，武媚娘坚持认为皇后是杀人凶手，可当皇后离开时，小公主明明安然无恙，武媚娘手中没有证据，有口难辩，反倒被皇后反咬一口，将杀女罪名一股脑推给了武媚娘，令武媚娘哑巴吃黄连，有苦说不出！狄仁杰认为此事颇有蹊跷，便将调查的责任统统揽了过来，准备查个水落石出。
虽然有狄仁杰帮忙，武媚娘到底是痛失了爱女，她肝肠寸断，痛不欲生，那梨花带雨的模样让所有人都为之动容。红巾愤愤不平，明明是王皇后心怀不轨，却冤枉武媚娘，实在太可恶了！阎立本感到不可思议，如果皇后真的是凶手，那她到底用了何种杀人手法，能在离开后掐死小公主呢？
狄仁杰隐约察觉到此事不简单，他心中愁绪万千，于深夜想起今天是慕容清的生辰，便特意来到牢狱中为她过生日，慕容清深受感动，连连垂泪，可是她在生日夜许下的愿望竟然是不再见狄仁杰，慕容清心中有苦难言，十分痛苦。
在朝堂上，武媚娘杀害亲生女儿的事情火速传开，大臣们纷纷上奏，认为武媚娘阴狠毒辣，精神也很有可能出了问题，这样的女人实在应该被定为死罪！皇上听着大臣的议论，不知所措，只有阎立本建议皇上等待狄仁杰查清真相后再做决定。