共66集
唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，在助其自救后，发现他是断案奇才。适逢皇上派他去感业寺查案，遂决定带狄仁杰一同前往。在感业寺，狄仁杰侦破奇案，化解了一场佛门大劫，并与武媚娘结缘。狄仁杰一鸣惊人，被皇上派往并州，在此期间，他屡破奇案，被称为神判。时有前朝鬼兵杀人事件，狄仁杰前去查看，发现与前朝宝藏及濮王李泰意图造反有关，却被毁灭证据，无法继续。此时，发生武媚娘杀害亲女，嫁祸王皇后之事，皇上召狄仁杰回长安调查。根据武媚娘提供的线索，狄仁杰破获此案，并在李泰的住所找到前朝宝藏，成为濮王谋反的确实证据。而狄仁杰也知道此前破案过程中每遇瓶颈时为他解惑的人竟是武媚娘，只觉武媚娘深不可测，野心更是超乎自己的想象。果然不久，唐高宗因风疾发作，让武媚娘一同上朝，合称二圣临朝。电视剧《通天狄仁杰》正在热播，讲述的是唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，发现他是断案奇才后被委以重任，在好搭档墨雨的协助下开始侦破一桩桩奇案的故事。剧中阚清子饰演的慕容清经历十分坎坷，而且身份不简单。刚开始的时候，狄仁杰一直都在破案，而武则天也从旁协助她，曾几何时，狄仁杰确实是对武则天，也就是民间的武媚娘动心过了的，但是慢慢地随着事情的一步步发展，他发现这个女人很有野心，也很有心计，远远不是自己所能够掌控的，而且她所显露出来的本事也注定了他们两个不能够相爱，之后又看到了武则天怀上了李治的孩子，所以更不可能在一起了。或许两个人有过好感，想要喜欢彼此，但是两个人的性格和内心决定了他们不能够走到一起。最后从历史上面看，两个人是好友，武则天一直很信任狄仁杰，有什么事情都会找他求助。是知己是好友。到底爱不爱，或许，只有他们自己知道了。
这一刻，慕容清与狄仁杰四目相对，慕容清再也按捺不住心中的情感，她泪眼婆娑，啜泣着询问狄仁杰，是否会怨恨自己一辈子？狄仁杰深情款款，眼神中满是温柔，对他而言，这辈子都无法放下慕容清，这份情意绵长，不掺杂一丝一毫的仇恨。有情人终于能坦白一切心事，他们在万丈深渊边紧紧拥抱，慕容清的哭声令狄仁杰心痛，更令他万分怜惜。拥抱过后，慕容清纵身跃入悬崖，她选择了结生命，狄仁杰大惊失色，也跟着跳下了深渊。
另一边的皇宫中，濮王正在幻想着明日的登基大典，他信心满满，认为明日自己就是真正的皇上了。谁知，这时宫门外传来了厮杀的声音，武媚娘和长孙无忌带着李绩将军赶来，狄仁杰也大难不死，来到宫中，濮王戴着皇上的面具，恶狠狠地指责众人要谋逆，李绩将军据理力争，他今夜执意驻守甘露殿，而墨雨也带着真正的皇上及时赶了回来，与假皇上对峙。
真皇上缓缓走到假皇上身边，他想问问自己的四哥，为什么要处心积虑下这么大的一盘棋，难道皇家富贵比兄弟情义还要重要吗？濮王见再难掩饰，便索性撕掉了面具，露出了真面目，濮王仍然大言不惭，他一字一句地责问狄仁杰，究竟谁才真正适合做大唐的皇帝？狄仁杰目光如炬，他认为自己只是做了应该做的事情，那就是不论何时都要取之有道！
就这样，濮王认输了，他终于说出了心声，不是他不念及兄弟之情，但只怪彼此生在了帝王之家，如今，成王败寇，濮王只希望皇上能坐稳皇位，成为一个好皇帝。武媚娘给皇上出主意，宣布濮王已经暴毙，而对外就宣称蒋昊辰是潜龙王。皇上采纳了这个建议，他下旨将濮王终身软禁在芙蓉园。
狄仁杰去探望濮王，他感慨着，濮王当初是何等风雅潇洒，难以想象他就是那个凶神恶煞、谋取天下的潜龙王。濮王微微一笑，如今已经沦为阶下囚的他，到现在都不明白，难道把天下交给自己有什么不好吗？自己的能力绝对可以把大唐带向盛世，为何狄仁杰偏偏不愿帮助自己呢？狄仁杰告诉濮王，当今圣上有一颗仁心，才，固然重要，德，才是根本。当两人谈完话，共同举杯饮酒，濮王突然毒发，原来，他早就想一死了之。就这样，不可一世的潜龙王销声匿迹了。
尘埃落定，狄仁杰此刻最感到痛心的，便是武媚娘再也不复当初的单纯善良。武媚娘哈哈大笑，自己虽然即将登上皇后宝座，但却根本不屑于这些，她原本以为，天下能懂自己的唯有狄仁杰一人，但如今发现大错特错。武媚娘知道狄仁杰不会留下来，便也不再强行挽留。
最终，狄仁杰准备返回汴州，他仍然想为百姓做实事。三天后，武媚娘开始执政，而汴州一切太平，狄仁杰无案可断，一片太平盛世。然而，狄仁杰难以忘怀的是，那日在悬崖下，自己本来已经抓住了慕容清的手，但她执意求死，跌入了深渊，这是狄仁杰永远的伤痛，狄仁杰独自呆坐在夜色中，仿佛又见到了慕容清，听见她询问自己是否想喝醉，狄仁杰的脸上露出了笑容……
（全剧终）