共66集
唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，在助其自救后，发现他是断案奇才。适逢皇上派他去感业寺查案，遂决定带狄仁杰一同前往。在感业寺，狄仁杰侦破奇案，化解了一场佛门大劫，并与武媚娘结缘。狄仁杰一鸣惊人，被皇上派往并州，在此期间，他屡破奇案，被称为神判。时有前朝鬼兵杀人事件，狄仁杰前去查看，发现与前朝宝藏及濮王李泰意图造反有关，却被毁灭证据，无法继续。此时，发生武媚娘杀害亲女，嫁祸王皇后之事，皇上召狄仁杰回长安调查。根据武媚娘提供的线索，狄仁杰破获此案，并在李泰的住所找到前朝宝藏，成为濮王谋反的确实证据。而狄仁杰也知道此前破案过程中每遇瓶颈时为他解惑的人竟是武媚娘，只觉武媚娘深不可测，野心更是超乎自己的想象。果然不久，唐高宗因风疾发作，让武媚娘一同上朝，合称二圣临朝。电视剧《通天狄仁杰》正在热播，讲述的是唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，发现他是断案奇才后被委以重任，在好搭档墨雨的协助下开始侦破一桩桩奇案的故事。剧中阚清子饰演的慕容清经历十分坎坷，而且身份不简单。刚开始的时候，狄仁杰一直都在破案，而武则天也从旁协助她，曾几何时，狄仁杰确实是对武则天，也就是民间的武媚娘动心过了的，但是慢慢地随着事情的一步步发展，他发现这个女人很有野心，也很有心计，远远不是自己所能够掌控的，而且她所显露出来的本事也注定了他们两个不能够相爱，之后又看到了武则天怀上了李治的孩子，所以更不可能在一起了。或许两个人有过好感，想要喜欢彼此，但是两个人的性格和内心决定了他们不能够走到一起。最后从历史上面看，两个人是好友，武则天一直很信任狄仁杰，有什么事情都会找他求助。是知己是好友。到底爱不爱，或许，只有他们自己知道了。
皇上感到不可思议，禾府书斋乃是罪臣之宅，如何能用作飞升之地？可玄瑜面色镇定，称一切都是上天注定，前提条件是只需要狄仁杰前去压宅即可。皇上感到不妥，玄瑜退下后，他赶紧私下询问狄仁杰，有没有查到什么线索。狄仁杰将这几日自己搜查的结果一一奉告，他还说出了心中的猜想，杀害张大人的凶手就是玄瑜仙姑！皇上并非不相信狄仁杰的话，但现在苦于没有证据，无法将玄瑜缉拿归案。皇上心中还挂念着武媚娘，狄仁杰便形容了一番冷宫内的凄凉光景，皇上听着听着，眼眶不由得红了，他心中不忍，更不相信武媚娘是狐妖，所以当务之急是赶紧揭穿玄瑜的真面目，还武媚娘一个清白。
告底。别了皇上，狄仁杰和墨雨来给武媚娘送饭，结果看见武媚娘独自伤神，明日就是中秋了，可自己和小皇子却要在冷宫里度过这个最团圆的节日，实在令人伤感。武媚娘回忆着自己一路走来的经历，着实坎坷，一波三折，可终于还是顺利产下了皇子，可如今皇子未满周岁，便同自己一起被打入冷宫，不知上天为何要如此安排，让自己面对这么多劫难？狄仁杰只好好言安慰，武媚娘的眼睛里露出了坚毅的光芒，她决定振作起来，与命运和坏人作斗争。
当武媚娘听闻，玄瑜让狄仁杰去压宅，不禁大吃一惊，玄瑜明知道狄仁杰会在压宅时仔细查看，为什么还挑选他去压宅呢？大家想破脑袋也不知道玄瑜葫芦里卖的是什么药，狄仁杰干脆把心一横，不入虎穴焉得虎子，他准备好好探一探玄瑜的底。
狄仁杰来拜见濮王，两人相谈甚欢，濮王觉得玄瑜的确气质超群，但此人与皇宫搅在一起，必定有不可告人的秘密。不知为何，狄仁杰有一种预感，玄瑜的背后一定与天下最大的势力有关，那势力可能影响到当今皇上！可是，濮王不愿讨论这些皇家争端，他更愿意同狄仁杰一起品尝天地醉美酒。濮王感慨着，自己看似身份尊贵，但却无时无刻不被人监视着，濮王的眼神变得深邃不可捉摸，他话里有话地自言自语，自己虽然超凡世外，但是也很信念这长安城内的芙蓉园。
这时，墨雨前来寻找狄仁杰，称玄瑜要吩咐飞升压宅的事宜，狄仁杰赶紧前往，濮王注视着狄仁杰离开的背影，不知为何，面容竟变得异常冷酷。狄仁杰和阎立本随着玄瑜来到禾府书斋，玄瑜看着书斋的牌匾，似乎顿了一顿，满怀心事地带着狄仁杰走进去。只见禾府中一片荒凉，以前，禾大人是弘文馆的大学士，是一位高雅的人，只因为做过太子少傅，才被牵连进太子谋反一案，惨被处死。
玄瑜继续往里面走，她对禾府内的一切摆设似乎都了如指掌，话里话外还帮着禾大人说话。玄瑜吩咐狄仁杰，今晚要在禾府内潜心朗诵各家经典，她十分熟悉地走到落满灰尘的书架前，抽出几卷经书交给狄仁杰。可是，狄仁杰根本无心看经书，他正在冥思苦想之际，墨雨和红巾蓝绫衣闯了进来，他们都是来保护狄仁杰的！原来，红巾姐妹根本就没有离开长安，听说了宫中有人飞升，放心不下狄仁杰，才特意赶到了禾府书斋。