共66集
唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，在助其自救后，发现他是断案奇才。适逢皇上派他去感业寺查案，遂决定带狄仁杰一同前往。在感业寺，狄仁杰侦破奇案，化解了一场佛门大劫，并与武媚娘结缘。狄仁杰一鸣惊人，被皇上派往并州，在此期间，他屡破奇案，被称为神判。时有前朝鬼兵杀人事件，狄仁杰前去查看，发现与前朝宝藏及濮王李泰意图造反有关，却被毁灭证据，无法继续。此时，发生武媚娘杀害亲女，嫁祸王皇后之事，皇上召狄仁杰回长安调查。根据武媚娘提供的线索，狄仁杰破获此案，并在李泰的住所找到前朝宝藏，成为濮王谋反的确实证据。而狄仁杰也知道此前破案过程中每遇瓶颈时为他解惑的人竟是武媚娘，只觉武媚娘深不可测，野心更是超乎自己的想象。果然不久，唐高宗因风疾发作，让武媚娘一同上朝，合称二圣临朝。电视剧《通天狄仁杰》正在热播，讲述的是唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，发现他是断案奇才后被委以重任，在好搭档墨雨的协助下开始侦破一桩桩奇案的故事。剧中阚清子饰演的慕容清经历十分坎坷，而且身份不简单。刚开始的时候，狄仁杰一直都在破案，而武则天也从旁协助她，曾几何时，狄仁杰确实是对武则天，也就是民间的武媚娘动心过了的，但是慢慢地随着事情的一步步发展，他发现这个女人很有野心，也很有心计，远远不是自己所能够掌控的，而且她所显露出来的本事也注定了他们两个不能够相爱，之后又看到了武则天怀上了李治的孩子，所以更不可能在一起了。或许两个人有过好感，想要喜欢彼此，但是两个人的性格和内心决定了他们不能够走到一起。最后从历史上面看，两个人是好友，武则天一直很信任狄仁杰，有什么事情都会找他求助。是知己是好友。到底爱不爱，或许，只有他们自己知道了。
黑衣人跟墨雨打得不相上下，狄仁杰使出铁笔，珠子朝黑衣人脖子直线而去，眼见黑衣人性命攸关之际，却突被一银针所挡，救了黑衣人一命。狄仁杰等人见黑衣人武功高强，只得离开，墨雨从地上带走了鬼军身上所穿的一件衣袍。
狄仁杰返回府中正撞上慕容清收拾药箱离开，狄仁杰握紧慕容清双肩大声质问她，是不是她，却被慕容清辩过。狄仁杰虽怀疑那是慕容清玄丝神针所留，但知道她不可能在一个时辰内走一个来回。心中疑虑不定。慕容清提着药箱出门后扶着门框一人泣不成声。
狄仁杰假扮鬼将军进入陈大人府中，陈大人吓得跪地求饶，后发现是狄仁杰之后勃然大怒，狄仁杰解释说他想让陈大人看到凶手是如何装神弄鬼，戏弄他的其实是凶手。陈大人要求狄仁杰给他一个满意的答复。狄仁杰利用假人偶向陈大人展示了凶手的障眼法，凶手利用一面是叶子的翻转衣袍假冒鬼军蒙骗众人，陈大人却因为没抓到鬼军，不肯相信狄仁杰的话，说是狄仁杰的想象，声称若要让他相信鬼将军不是鬼，除非有人将那块巨石举起！墨雨忿忿不平，明明证据确凿陈大人却不肯相信，他怀疑陈大人有问题，狄仁杰却认为陈大人说得对，他们应该把所有的谜底都给解开。
狄仁杰在书房桌子上发现了一封信，是申大人的笔迹，根据这封信，狄仁杰怀疑申大人在死前已经把无字碑文翻译好了，而洛红尘的宝藏就是红尘六绝，而这红尘六绝可以治蓝绫的眼睛，因为红尘六绝之一能医不自医，便是能救天下病的灵药！众人听到这消息后都喜出望外。
狄仁杰根据信上第一句诗，“若得明朝乾坤变。”推断迎日亭是寻宝谜底开始的地方，几人来到迎日亭，狄仁杰看出石塔阵实则是一个太极八卦阵，每一个石塔都有三道纹理，代表易经八卦，中间两个小石塔代表乾坤两极，几人将两个小石塔倒转，意图达到“乾坤变”的效果。刚移动完石塔，独树林中出现过的黑衣人就朝他们攻了过来，几人根本不是对手，眼见生死关头，慕容清出现救了他们。狄仁杰根据王召燕回忆洛秋山被杀害的情形，凶手用的是剑气杀人，而这世上用剑气的人没有几个，推断黑衣人就是杀死洛秋山的凶手。
黑衣人因慕容清救狄仁杰而和她起了争执，恰在此时，主上赶来，原来这迎日亭乾坤变的谜题正是主上给狄仁杰的，因为狄仁杰想问题独特，且为人执着，接连戳破鬼军阴谋，天下间很少有问题能难到他，他很快都能找到答案。主上想让狄仁杰参与到寻找宝藏的计划中，借助狄仁杰之力，来助他寻找宝藏。黑衣人称这样未免太危险了，主上却不以为然。
狄仁杰连夜研究“明朝乾坤变”谜题，研究了一晚上也毫无头绪。次日一早红巾给狄仁杰送来吃的。心疼他为解谜连夜奋战，不惜伤了身子。