共66集
唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，在助其自救后，发现他是断案奇才。适逢皇上派他去感业寺查案，遂决定带狄仁杰一同前往。在感业寺，狄仁杰侦破奇案，化解了一场佛门大劫，并与武媚娘结缘。狄仁杰一鸣惊人，被皇上派往并州，在此期间，他屡破奇案，被称为神判。时有前朝鬼兵杀人事件，狄仁杰前去查看，发现与前朝宝藏及濮王李泰意图造反有关，却被毁灭证据，无法继续。此时，发生武媚娘杀害亲女，嫁祸王皇后之事，皇上召狄仁杰回长安调查。根据武媚娘提供的线索，狄仁杰破获此案，并在李泰的住所找到前朝宝藏，成为濮王谋反的确实证据。而狄仁杰也知道此前破案过程中每遇瓶颈时为他解惑的人竟是武媚娘，只觉武媚娘深不可测，野心更是超乎自己的想象。果然不久，唐高宗因风疾发作，让武媚娘一同上朝，合称二圣临朝。电视剧《通天狄仁杰》正在热播，讲述的是唐高宗年间，阎立本偶遇狄仁杰蒙冤入狱事件，发现他是断案奇才后被委以重任，在好搭档墨雨的协助下开始侦破一桩桩奇案的故事。剧中阚清子饰演的慕容清经历十分坎坷，而且身份不简单。刚开始的时候，狄仁杰一直都在破案，而武则天也从旁协助她，曾几何时，狄仁杰确实是对武则天，也就是民间的武媚娘动心过了的，但是慢慢地随着事情的一步步发展，他发现这个女人很有野心，也很有心计，远远不是自己所能够掌控的，而且她所显露出来的本事也注定了他们两个不能够相爱，之后又看到了武则天怀上了李治的孩子，所以更不可能在一起了。或许两个人有过好感，想要喜欢彼此，但是两个人的性格和内心决定了他们不能够走到一起。最后从历史上面看，两个人是好友，武则天一直很信任狄仁杰，有什么事情都会找他求助。是知己是好友。到底爱不爱，或许，只有他们自己知道了。
狄仁杰分析道，当时走进禾府书斋的新娘也许不是莺莺！可是红巾姐妹当天是寸步不离地跟踪莺莺，的确看见她亲自上了喜轿，又从轿子上下来。狄仁杰困惑不解，长安帮派人送来一封信，原来他们已经找到了神镜书生的踪迹！说时迟那时快，狄仁杰赶紧前往长乐帮，只见院子内坐着四个白衣飘飘的青年男子，他们气焰嚣张，让狄仁杰猜测谁才是真正的神镜书生？狄仁杰仔仔细细打量了一番，发现这四个人着装上都有不妥，只能是神镜书生的徒弟罢了。果然，狄仁杰话音刚落，真正的神镜书生走了出来，他解答了关于透光镜的谜团，投射在墙上的图案也许不在镜子的背面。
另一边，皇上准备大肆封赏玄瑜道姑，甚至要对她委以重任，阎立本出言阻挠，但却没有成功，玄瑜则一脸大义凛然的模样，谢过圣恩，称会将道教发扬光大。而后，马上有大臣出言举荐蒋昊辰，皇上便命蒋昊辰为大理寺丞，代替申大人的职位。正当文武百官纷纷祝贺时，朝廷上，长孙大人突然晕倒，引起了不小的恐慌，而为长孙大人看病的人正是慕容清。
阎立本去找许大人，询问他是否掌管飞升所需要的物品，许大人干脆承认，本来这一切都应该是自己和礼部准备，但是玄瑜坚持称一切物品都要自己准备，因为只有做过法后才能生效。狄仁杰和墨雨等人一起研究着八卦镜，终于发现，图案并不是在八卦镜的背面，而是就在镜面之上，通过反光，将狐狸影子投射在墙壁上！于是，狄仁杰与阎立本潜入了玄瑜的住处，发现当日抬着莺莺的轿子是个轿中轿！看来，这就是将莺莺狸猫换太子的真相。
红巾姐妹在房间里担心着狄仁杰的安危，尤其是红巾，对狄仁杰可谓是心心念念，蓝绫不免想劝告妹妹，在狄仁杰心中，只有慕容清的位置，还是不要单相思的好。可是红巾根本听不进去， 她只希望蓝绫不要同自己争狄仁杰了。这时，狄仁杰已经赶了回来，两姐妹马上住了声，认真听狄仁杰讲述刚刚发生的一切。
狄仁杰分析道，穿着喜服的凶手一早就藏在了轿子里，等到莺莺进来，便用迷香将其迷晕，再用绳子把莺莺勒死，藏进了轿子的暗格中，而由于凶手早就服用解药，所以不会被迷香迷晕，凶手便正好可以假扮成莺莺，进入禾府书斋，而申大人也早就被玄瑜杀死了！看来，玄瑜一定有一个孪生姐妹，或者易容成与她一模一样的人，彼此照应完成了杀人计划。
而且，不知道为什么，狄仁杰总觉得玄瑜同禾府书斋有着千丝万缕的联系，而玄瑜姓季，把季字拆开，便是禾之子！难道，玄瑜竟是禾家的后人吗？另一边，长孙大人终于苏醒，但身体还有些虚乏，只能卧床静养。