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1884年法国欲吞安南（即越南），夺我西南。清廷畏于压力，准备放弃安南，黑旗军首领刘永福为保桑梓，拒不听旨，与朝廷传旨小官唐景崧并肩战斗，率兵大破法军。李鸿章怀有私心，匿捷不报，反而夸大法国实力，渲染失败。清廷签下不平等条约。使中法战争“不败而败”。唐景崧因功升任台湾道，刘永福则率领黑旗军改编为官军，任南澳岛总兵。转眼十年，日本野心毕露，海陆两路进攻中国。李鸿章为保实力，欲与之议和，结果水师全军覆没，继而签订了卖国的《马关条约》。台湾军民，群情激奋。唐景崧为保官禄，唯命与朝廷。而刘永福率军渡台，团结台湾志士和同胞，坚决血战保台，不幸，台湾沦陷了，但台湾人民抗击日军的斗争延续多年。回归祖国的信念一如既往。
左宗棠在弥留之际，念念不忘台湾建省，但还是未能等到皇帝亲允建立台湾省的好消息就殉职于福州任上。朝廷得此消息，纷纷悼念左宗棠，并在京都设立专祠祭奠，醇亲王代天子致祭。 西太后一面应允建立海军衙门，一面提出修建园林供她养老。醇亲王无银子，只好求助李鸿章。建立完善的海军需要花费大量银两，而修建园林更是花钱如流水，李鸿章为此也一筹莫展，此时孙毓汶提议设立“海防捐”，借此敛财，以解办海军和修园林之难。 光绪十一年九月初五，清廷终于下旨台湾改为行省，命刘铭传为首任巡抚。于第二日，设立总理海军事务衙门，醇亲王为总办大臣，李鸿章为会办大臣。1885年10月12日，台湾府终于改为台湾省。 李鸿章让刘铭传出任海军会办，刘多次婉拒。李鸿章打算上折请奏，孙毓汶则自告奋勇，认为有能力让刘铭传回心转意。