共35集
该剧讲述了二战时期，北京故宫七千箱国宝文物被紧急转运四川峨眉山。而这批文物中，传说有一枚努尔哈赤印章上隐藏着宝藏的秘密，从而吸引了日本间谍前去寻找。富大龙饰演的叶钊便化作三重身份来到峨眉山，继而与高洋饰演的进步青年沈婕在组织的安排下结为“假夫妻”，共同保卫国家财产的故事。1942年，七千箱北京故宫的国宝被运到峨眉山，其中一枚印玺隐藏着满清千吨黄金的藏宝图。日军想借此补充军饷，遂派遣间谍，欲夺印玺。中共地下党截获了这一情报，派特工叶钊伪装成文物专家，潜入日谍内部。然而叶钊的身份几番遭质疑，屡遇险情，他与县长女儿沈婕结为假夫妻，周旋于国民党内部倾轧与峨眉日谍网络之间，又与爱国军人柳絮飞暗中联手，杀了日谍头目神父，保护了国宝。新的日谍头目再次打入峨眉，要在抗战最艰难的阶段，轰炸蒋府官邸，打击中国抗日的信心。叶钊必须在日谍网络里继续潜伏以获取新情报。在战友牺牲生命掩护下，叶钊重新打入日谍内部，发报修改了航向坐标，日军轰炸机撞山而亡。峨眉“秀甲天下”的风光之下，虽无硝烟，却激战正酣。 《密战峨眉》是一部反映抗战时期故宫文物避难峨眉，以一部间谍战为主题的电视剧。1933年抗日战争爆发前夕，华北形势告急，故宫博物院决定将馆藏精品转移，以避战火浩劫。自此之后的15年中，近百万件分享者电视故宫文物历尽艰辛坎坷，行程数万公里，由北京经上海、南京辗转运抵四川、贵州，至抗战结束后，再陆续运回南京。这一捍卫中华民族文化瑰宝的雄伟壮举，是中国人民在惨烈的反法西斯战争环境下创造的保护人类文化遗产的伟大奇迹。
沈婕让叶钊睡在床上，他让她在自己打呼噜时提醒一下，叶钊想着凤凰的到来不知道下一步该如何来办。凤凰让黄四郎找青龙山的二当家，他还派人跟踪张金石并监视沈婕。叶钊出门后发现有人跟踪，他和沈婕掉头回去，可房间后害怕有监听，所幸检查之后十分安全。叶钊感觉沈婕也在监狱范围之内，她有些紧张，叶钊建议她以后少出去为好。
沈婕的选择让柳絮飞放下包袱，他上战场不是为了功名利禄，只是想为国尽忠。柳絮飞拿着怀表给警察局长看，警方对于剿匪的事情并不放在心上，他们只想图个安稳现实。沈敬斋看到县政府的财务账目后问起剿匪专款，这才得知胡亦中要对剿匪专款进行专款专用，沈敬斋向胡亦中询问起来，他的话让胡亦中明白该怎么样做。
沈敬斋将剿匪款项的获取渠道告诉了胡亦中，他清楚人最关键，沈敬斋不在乎一时的好处，只要能细水长流就好。沈敬斋让会计查清楚汇款方向中，还让她直接汇报上来。沈婕向董佶承认了错误，她知道自己的行为有些鲁莽，叶钊让沈婕别让人抓到把柄。柳絮飞和凤凰来到沈敬斋家中，凤凰向沈敬斋道歉，沈婕知道后出去查看情况。
沈敬斋没有收凤凰送的礼，胡亦中去重庆后沈敬斋命人马上实施监控。沈婕和叶钊出来后见到凤凰和柳絮飞，凤凰还故意要送沈婕一些礼物，叶钊让她收下来。柳絮飞向叶钊和沈婕说起姑妈的情况，沈婕还说起柳絮飞去前线的事情，凤凰很意外，她向柳絮飞打听起入缅作战的高级将领，这引起了沈敬斋和叶钊的怀疑。
沈敬斋打开胡亦中办公室的保险箱后拿到录音磁带和一些文件，胡亦中回来后去看望白玉兰，还给她送了礼物，白玉兰得知他是军统川南情报站副站长。胡亦中在办公室里感觉有些不对，他发现了保险柜有被动过的痕迹，打开后发现那些东西都不见了，他知道是沈敬斋所为。柳絮飞听到枪声后过去查看情况，他通过望远镜看到一群人，过去之后发现是黄四郎带着家人在狩猎。凤凰带着东西趁柳飞不地时去了大伟寺，黄四郎带人打猎是她故意安排的。