共35集
该剧讲述了二战时期，北京故宫七千箱国宝文物被紧急转运四川峨眉山。而这批文物中，传说有一枚努尔哈赤印章上隐藏着宝藏的秘密，从而吸引了日本间谍前去寻找。富大龙饰演的叶钊便化作三重身份来到峨眉山，继而与高洋饰演的进步青年沈婕在组织的安排下结为“假夫妻”，共同保卫国家财产的故事。1942年，七千箱北京故宫的国宝被运到峨眉山，其中一枚印玺隐藏着满清千吨黄金的藏宝图。日军想借此补充军饷，遂派遣间谍，欲夺印玺。中共地下党截获了这一情报，派特工叶钊伪装成文物专家，潜入日谍内部。然而叶钊的身份几番遭质疑，屡遇险情，他与县长女儿沈婕结为假夫妻，周旋于国民党内部倾轧与峨眉日谍网络之间，又与爱国军人柳絮飞暗中联手，杀了日谍头目神父，保护了国宝。新的日谍头目再次打入峨眉，要在抗战最艰难的阶段，轰炸蒋府官邸，打击中国抗日的信心。叶钊必须在日谍网络里继续潜伏以获取新情报。在战友牺牲生命掩护下，叶钊重新打入日谍内部，发报修改了航向坐标，日军轰炸机撞山而亡。峨眉“秀甲天下”的风光之下，虽无硝烟，却激战正酣。 《密战峨眉》是一部反映抗战时期故宫文物避难峨眉，以一部间谍战为主题的电视剧。1933年抗日战争爆发前夕，华北形势告急，故宫博物院决定将馆藏精品转移，以避战火浩劫。自此之后的15年中，近百万件分享者电视故宫文物历尽艰辛坎坷，行程数万公里，由北京经上海、南京辗转运抵四川、贵州，至抗战结束后，再陆续运回南京。这一捍卫中华民族文化瑰宝的雄伟壮举，是中国人民在惨烈的反法西斯战争环境下创造的保护人类文化遗产的伟大奇迹。
沈敬斋和徐立兴喝完酒后回到家中，他向女儿说起胡亦中被抓，沈婕拿出绣品送给他，又说起筹办圣诞之事，沈敬斋高兴之余答应下来。柳絮飞见到黄浦师兄老孙，他是在长沙战役中受伤，柳絮飞梦想上前线杀敌报国，他听说胡亦中被惩之以法后想法会派往自己回大佛寺。叶钊将白玉兰的真实身份告诉沈婕，他让她配合她的行动。
白玉兰利用沈敬斋不在家中之机来到，叶钊配合她行动，白玉兰打开保险柜后拍下拓片的照片后放回去，她查看其他资料时被叶钊催促，他们都没有留意保险柜里掉出的东西。叶钊在掩护白玉兰离开时见到沈敬斋回来，他赶快将她逼到墙解故意表现出亲热之举，沈敬斋急忙躲避开。
沈敬斋回房间后发现保险柜被动过，他用拓片得到了那些脚印，他怀疑是沈婕。白玉兰看到的拓片和叶钊交给她们的一样，只是没找到其他有价值的情报。凤凰对叶钊并不信任，她想让白玉兰动手除掉，白玉兰替他在凤凰面前说好话。沈婕不理解叶钊的做法，她十分生气地冲他发脾气，叶钊解释说是为了任务，两人在屋里打闹起来。
白玉兰向叶钊问起对沈婕的感情，他说和沈婕只是逢场作戏，叶钊面对问话说起那天胡亦中的事情，他说那天回来只是偶然。叶钊劝白玉兰不要太拼命，要学会珍惜自己。老董命人将机密文件处理掉，凤凰以抓药为名来到老董的店铺中，老董将药拿给她后凤凰离开。老董命人先行转移，他马上转移会对叶钊不利，并嘱咐伙计们在出入药店里一定要小心。凤凰回去后十分失望，她啥也没拿到。
沈敬斋向沈婕问起他保险柜被打开之事，面对他的咄咄逼问让沈婕有些惊慌，沈敬斋知道打开保险柜的人只有职业特工，还怀疑到叶钊身上。柳絮飞在门口听到沈婕和沈敬斋在屋里对话，沈婕失口否认，沈敬斋拿出拓片上的脚印给她看，她说那根本不是自己的。柳絮飞以还东西为由将沈婕叫到屋外，沈敬斋对脚印不解。柳絮飞向沈婕问起叶钊为人，他已经准备好入缅准备工作，叶钊走进来后被柳絮飞质疑起身份，两的对话是心照不宣。沈婕向叶钊说起沈敬斋怀疑脚印之事，她被吓坏了。