共58集
战国末期，荆轲刺秦失败牺牲。天下第一剑客盖聂受荆轲所托，护送荆轲之子荆天明躲避秦王追杀。在秦国边境残月谷，盖聂一人击退三百秦国铁骑，秦王震怒，命丞相李斯务必铲除两人。李斯在阴阳家东皇太一的指引下寻访到了盖聂的同门兄弟卫庄，卫庄剑术超群却始终居于盖聂之下，为夺得天下第一剑的名号，卫庄答应了李斯的要求，殊不知自己已经掉入了东皇太一的圈套。原来天明在出生之时，身上便被阴阳家偷偷种下“乾元玉煞”，“乾元玉煞”关系到一个巨大阴谋。逃亡路上，盖聂与天明结识了墨家众高手，以及楚国大将后人项少羽和墨家少女高月，一行人在命运的引领下进入被誉为世间最后一片净土的墨家机关城。机关城隐匿于绝岭雄峰之间，集结了墨家深厚的智慧，是天下所有反秦势力最后的堡垒，它也是墨家弟子最后的避难所。面对固若金汤的墨家机关城，赵高先用激将法又一次挑起卫庄的怨恨，继而又用权力诱惑卫庄，让他相信只要胡亥登基，卫庄就能拥有自己一直梦寐以求的权利与地位。为了攻破机关城，秦王派出庞大的精锐之师，卫庄找到了公输家族的掌门公输仇，公输仇与墨家世代为仇，机关城严密的防守工事受到了前所未有的挑战。卫庄刺客团中的数名高手亦纷纷出动，一时间，机关城内杀机迭起、暗流涌动。
卫庄将蓉儿放还给盖聂，心有不甘的赤练却趁众人放松之际甩出毒镖，想要从背后偷袭盖聂。蓉儿发觉了赤练的暗算，情急之下推开盖聂，自己却中了毒镖，盖聂赶紧将蓉儿抱住。蓉儿见盖聂如此关心自己，感动之下问盖聂如果自己死了，他会不会一辈子记得自己。盖聂真情流露，向蓉儿保证自己绝对不会让她死去。
盖聂举起剑要求赤练交出解药，没想到蓉儿竟然自己用针灸将飚上的毒化解了。原来，来时的路上蓉儿早就将赤练解毒所用到的穴位记了下来，之所以拖到现在才解毒，其实是想问出盖聂对自己的真实感情。
见蓉儿身体无大碍，盖聂背着蓉儿踏上了往终南别馆的归程。禁不住蓉儿的追问，盖聂终于承认自己早就把蓉儿当做心里最重要的人，一直没有说出口，是因为荆轲与蓉儿是义兄妹，怕自己的过去会令蓉儿为难。蓉儿亲吻了盖聂的脸颊，向他宣示无论发生什么事情，自己都愿意与他一起承担。
赤练和白凤本是一对失去了亲人的苦命姐弟，是卫庄在废墟之中发现了年幼的二人，并将他们带回了七杀门。死门的训练非常之残酷，两个孩子都咬牙坚持了下来。
时光荏苒，当年的两个幼童已经成长为出色的杀手。而身体日渐成熟丰盈的赤练，更是激起了师傅的色心。在一次成功执行任务后，师傅对赤练语出轻薄，欲行不轨之事。白凤见姐姐吃亏，飞身上前，击开了师傅的手。兄妹联手却终究因为实力差距，败给了师傅，赤练被关到了牢里。
卫庄得知赤练被罚的原委后，亲自到牢里送饭，鼓励她努力练功，堂堂正正的雪耻。赤练开始专攻施毒术，终于将师傅打败，卫庄将名为赤练的软剑赠给赤练当礼物，令原本就爱慕卫庄的赤练更加死心塌地。卫庄却告诉她，“习武之人最好不要有感情”。
毒镖偷袭的事情令卫庄十分生气，掌掴了赤练，并命令她以后不得擅自行动。赤练这些年来所做的一切都是为了能博卫庄一笑，此次卫庄因盖聂对自己动怒，令她对盖聂的恨又加深了一番。白凤劝赤练不要再做有失尊严的事情，赤练仍执意要杀掉盖聂。
得到了自己渴望已久的掌门令，卫庄立誓不惜付出一切代价重振七杀门。
雪女终于在一家酒馆找到了小高。可如今的小高早就舍弃了当年的意气风发，日日在酒馆买醉，小高每喝一碗酒，雪女的心中便更痛苦一分。小高说自己助纣为虐三十年，已经失去了活下去的意义。雪女却紧紧的将小高抱住，告诉他，自己愿意陪他寻找活下去的意义。