共58集
战国末期,荆轲刺秦失败牺牲。天下第一剑客盖聂受荆轲所托,护送荆轲之子荆天明躲避秦王追杀。在秦国边境残月谷,盖聂一人击退三百秦国铁骑,秦王震怒,命丞相李斯务必铲除两人。李斯在阴阳家东皇太一的指引下寻访到了盖聂的同门兄弟卫庄,卫庄剑术超群却始终居于盖聂之下,为夺得天下第一剑的名号,卫庄答应了李斯的要求,殊不知自己已经掉入了东皇太一的圈套。原来天明在出生之时,身上便被阴阳家偷偷种下“乾元玉煞”,“乾元玉煞”关系到一个巨大阴谋。逃亡路上,盖聂与天明结识了墨家众高手,以及楚国大将后人项少羽和墨家少女高月,一行人在命运的引领下进入被誉为世间最后一片净土的墨家机关城。机关城隐匿于绝岭雄峰之间,集结了墨家深厚的智慧,是天下所有反秦势力最后的堡垒,它也是墨家弟子最后的避难所。面对固若金汤的墨家机关城,赵高先用激将法又一次挑起卫庄的怨恨,继而又用权力诱惑卫庄,让他相信只要胡亥登基,卫庄就能拥有自己一直梦寐以求的权利与地位。为了攻破机关城,秦王派出庞大的精锐之师,卫庄找到了公输家族的掌门公输仇,公输仇与墨家世代为仇,机关城严密的防守工事受到了前所未有的挑战。卫庄刺客团中的数名高手亦纷纷出动,一时间,机关城内杀机迭起、暗流涌动。
赵高在早朝上得知章邯投降项氏的消息十分生气,太尉告诉他,咸阳城内已经无兵可调,只能靠死守函谷关和武关来争取时间。赵高回到阴阳家,感到自己越来越力不从心,焚香占卜,祈求神明慈悲。大司命禀报说,已将玉煞和玉珪带回,令赵高十分高兴。大司命又汇报说天明已经相信只有彻底开启玉煞之力的法阵才能救月儿,让赵高在见到他二人的时候欲擒故纵,让天明相信月儿的死活全掌握在赵高的手中。
天明在陪月儿玩人偶,月儿按照计划装作神智尚未恢复的样子,赵高与大司命推门进屋,月儿吓得缩到了墙角。天明与赵高单独相谈,赵高说玉珪之力一直在蚕食月儿的身体,只有自己和羲氏一族的人开启乾坤法阵将月儿体内的玉珪之力转移到天明的身体里,待玉煞之力彻底开启后,月儿自然就会得救。赵高说只要天明心甘情愿的帮自己铲除掉叛党逆贼,就答应救月儿,并且在事成之后可以让他们二人双宿双飞。天明说自己为了救月儿什么都愿意做,又提出条件让月儿和素影见面,赵高答应了下来。
赵高带着天明巡查法阵,向他讲解实施法阵的过程,见天明对大司命很信任,赵高命大司命安排布置法阵的事宜。大司命建议先给天明一些甜头,安抚住已经可以自由掌控玉煞之力的天明。赵高采纳了建议,耗费灵力为月儿施法缓解痛苦,又答应随时可以带月儿去见素影。
月儿与天明和赵高来到停棺室,见到了素影。疯疯癫癫的素影把月儿当做碧华,月儿提出想把姨母(素影)带出停棺室,赵高命人将素影送回到原来住的地方。
大司命以阵图是机密为由,将运送黑土和金粉的手下遣走,又拿出一盒朱砂,施法在祭坛上布置了法阵。大司命告诉天明,消解玉煞之力需要以火属性的朱砂为引,而彻底开启玉煞之力则需要金属性的金粉为引。两种阵法需要的咒符截然相反,自己会用黑土盖住朱砂,再用金粉画出另一个阵法,并使之失效。天明感激大司命的帮助,大司命说待阵法启动,玉煞和玉珪之力会从天明和月儿的体内抽离,当它们融合在一起的时候会产生巨大的力量,将在场所有的施法者杀死,他要让赵高临死之前亲眼看见期盼了一辈子的东西是如何毁灭的。
月儿给疯癫的素影梳头,赵高在门外偷偷监视。待赵高走后,月儿对素影说自己和母亲已经原谅了她,等完事之后就带她回家。
阵法布置完成,赵高命大司命带着其他人熟悉一下阵图。云中君发觉阵法有异,趁夜划船到祭坛再次检查,发现了黑土中掺有的硝石和下面的朱砂阵法,为了不使云中君破坏计划,大司命用火法术将其击杀。第二天,众人发现了云中君的死,以为他是为寻玉佩,失足落水而死。
月儿时日不多,来不及再培养新人熟悉阵法,大司命主动请命顶替云中君参与施法,赵高同意他的请求,宣布玉珪血祭如期举行。
大司命到少司命的坟前,让她等着自己。得知大司命也会参与施法,天明十分担心。大司命说自己对少司命的感情,就像天明对月儿一样,等事情完成,既替她报了仇,又可完成她生前的夙愿。天明将混元珠还给大司命,感激他所做的一切,并深深的鞠躬向其拜别。
月儿换好了衣服,向赵高提出要带素影一起去,为了让月儿听话,赵高同意了她的请求。
大司命趁四下无人之时,偷偷将有毒的珠子投入火炬中,命手下酉时三刻准时点火。赵高将素影留在岸边,带着天明和月儿划船到祭坛,启动了法阵。
素影听到卫兵说赵高要用玉珪血祭,想起了过往的种种,趁卫兵不注意时跳入船中,划向祭坛。