共58集
战国末期,荆轲刺秦失败牺牲。天下第一剑客盖聂受荆轲所托,护送荆轲之子荆天明躲避秦王追杀。在秦国边境残月谷,盖聂一人击退三百秦国铁骑,秦王震怒,命丞相李斯务必铲除两人。李斯在阴阳家东皇太一的指引下寻访到了盖聂的同门兄弟卫庄,卫庄剑术超群却始终居于盖聂之下,为夺得天下第一剑的名号,卫庄答应了李斯的要求,殊不知自己已经掉入了东皇太一的圈套。原来天明在出生之时,身上便被阴阳家偷偷种下“乾元玉煞”,“乾元玉煞”关系到一个巨大阴谋。逃亡路上,盖聂与天明结识了墨家众高手,以及楚国大将后人项少羽和墨家少女高月,一行人在命运的引领下进入被誉为世间最后一片净土的墨家机关城。机关城隐匿于绝岭雄峰之间,集结了墨家深厚的智慧,是天下所有反秦势力最后的堡垒,它也是墨家弟子最后的避难所。面对固若金汤的墨家机关城,赵高先用激将法又一次挑起卫庄的怨恨,继而又用权力诱惑卫庄,让他相信只要胡亥登基,卫庄就能拥有自己一直梦寐以求的权利与地位。为了攻破机关城,秦王派出庞大的精锐之师,卫庄找到了公输家族的掌门公输仇,公输仇与墨家世代为仇,机关城严密的防守工事受到了前所未有的挑战。卫庄刺客团中的数名高手亦纷纷出动,一时间,机关城内杀机迭起、暗流涌动。
体力耗尽后天明晕倒在池中,盖聂和少羽赶来将他救上岸,墨家众人通过逃生之门离开了机关城。逃到安全的地方后,巨子体内的六离毒术发作,倒地昏迷。醒来后,终于与如儿(月儿)相认。
天明动用玉煞之力,筋脉尽毁,生命垂危。巨子深知自己所剩时间不多,为了能救治天明再做一件有意义的事情,不顾众人的阻拦,将内力全部传给了天明。失去了内力的保护,巨子奄奄一息。锤哥责骂天明只会带来灾祸,巨子却要传位给天明。
白凤给赤练上药,赤练醒来后扇了白凤一个嘴巴,怨他没有救出卫庄。白凤对赤练一直心存爱慕,见她只惦记卫庄,提醒她不要忘记幼年时承诺,会永远陪着自己,保护自己的话。赤练推开抱住自己的白凤,跑回城中找卫庄。赤练徒手挖开废墟,希望能找到卫庄。
机关城毁灭,公输仇神志不清,在跪地告慰列祖列宗时,看到了那把写着小九的刻刀,却不记得小九就是自己。
扶苏带兵救出了困在城中的秦兵,士兵们感激扶苏的救命之恩,愿意誓死效忠。一个赵高的亲信,偷偷飞哥传书回咸阳。
巨子让天明拜进墨门,天明说自己不配。巨子告诉天明,他情愿舍弃自己的生命,救出众人,正是侠义之心的体现。更何况,天明已经通过了试炼之路,证明他有能力、有勇气,足以胜任巨子之位。为了让大家能够接受天明,巨子不惜恳求墨家弟子。
天明终于答应拜入墨门,接过了象征巨子身份的宝剑。巨子让天明答应自己三件事,一、要努力成为像盖聂一样的大侠;二、同龄墨家弟子,全力辅佐扶苏登上帝位,让他善待百姓;三、要拼尽一切保护好如儿(月儿)。天明答应了巨子的嘱托,月儿答应巨子,自己会笑着过每一天,巨子含笑而终。
少羽独自来到江边,想到墨家要全力辅佐的是扶苏而不是自己,心中苦闷,不禁仰天大问“为什么”。
蓉儿发烧,盖聂怀疑是中了毒,请月儿去查看一下。月儿沉浸在失去父亲的痛苦中,难以自拔。盖聂开导月儿要振作,不要再失去第二个对自己至关重要的人。