共58集
战国末期,荆轲刺秦失败牺牲。天下第一剑客盖聂受荆轲所托,护送荆轲之子荆天明躲避秦王追杀。在秦国边境残月谷,盖聂一人击退三百秦国铁骑,秦王震怒,命丞相李斯务必铲除两人。李斯在阴阳家东皇太一的指引下寻访到了盖聂的同门兄弟卫庄,卫庄剑术超群却始终居于盖聂之下,为夺得天下第一剑的名号,卫庄答应了李斯的要求,殊不知自己已经掉入了东皇太一的圈套。原来天明在出生之时,身上便被阴阳家偷偷种下“乾元玉煞”,“乾元玉煞”关系到一个巨大阴谋。逃亡路上,盖聂与天明结识了墨家众高手,以及楚国大将后人项少羽和墨家少女高月,一行人在命运的引领下进入被誉为世间最后一片净土的墨家机关城。机关城隐匿于绝岭雄峰之间,集结了墨家深厚的智慧,是天下所有反秦势力最后的堡垒,它也是墨家弟子最后的避难所。面对固若金汤的墨家机关城,赵高先用激将法又一次挑起卫庄的怨恨,继而又用权力诱惑卫庄,让他相信只要胡亥登基,卫庄就能拥有自己一直梦寐以求的权利与地位。为了攻破机关城,秦王派出庞大的精锐之师,卫庄找到了公输家族的掌门公输仇,公输仇与墨家世代为仇,机关城严密的防守工事受到了前所未有的挑战。卫庄刺客团中的数名高手亦纷纷出动,一时间,机关城内杀机迭起、暗流涌动。
小植一把抓住回来的少羽,让项氏一族给个说法。小植向大家讲述了事情的经过,当时项陶说山路陡峭,让大家下马步行,谁知没走几步,马儿受惊、捆绑箱子的绳子断裂,箱子都滚下了悬崖,山子为了保住箱子,也掉了下去。小植去找山子,只找到了他的尸体,和用命换来的一箱箱石头。后来小植仔细调查,发现这起事故出于人为,元凶就是项氏一族的项陶。小植指责天明袒护少羽,天明安抚住小植,让少羽查明真相给墨家一个交代。
少羽找天明单独谈话,告诉他是项梁偷换了宝藏,面对真相,天明无话可说。少羽将自己心中的苦闷也和盘托出,说墨家辅佐扶苏,背叛了项氏一族。少羽说扶苏是自己仇人的儿子,项氏一族早晚要找他报仇,让天明在扶苏和自己之间做出选择。天明告诉少羽,扶苏即位,天下得安,且为了救月儿,自己欠他一份人情,所以不能辜负他。天明劝少羽放弃仇恨,为天下百姓寻求乐土。少羽告诉天明,在他眼中的一己私怨,对自己来说就是国仇家恨。
被愤怒冲昏头脑的少羽,粗暴的将月儿拖到了野外。少羽向月儿表白,让她跟自己一起走,受惊的月儿拼命将少羽推开。失去了家业、兄弟、安身之所和爱情的少羽觉得人生没有意义,想让月儿跟自己一起跳崖。紧要关头,少羽终于恢复了理智,哭着抱住月儿拼命道歉,月儿用手轻拍少羽,安抚他。
少羽将月儿交还给四处寻找的盖聂等人,又给天明留信道别,并告诉他丢失宝藏的位置。项梁赶到飞天寨,向墨家承认事情都是自己做的。得知少羽已经离开墨家,项梁不但不觉理亏,反倒指责天明等人让少羽受了委屈,策马而去。
失意的少羽在酒馆喝得烂醉如泥,被人围殴,卫庄带赤练,将其救下。少羽醒酒后,卫庄告诉他,自己也经历过他所经历的一切,并再次提出合作夺取天下,报复那些背叛者。少羽转身背对卫庄,陷入了深思。
天明将自己雕刻的两个小人送给月儿,月儿想起在洛阳时候的事情,笑了起来。见月儿有表情,天明激动的又蹦又跳,赶紧将喜讯告诉了盖聂和蓉儿。盖聂建议让月儿重温旧事,唤醒记忆。天明和蓉儿带着墨家弟子布置出各种月儿经历过得场景,月儿的记忆也如碎片一样被渐渐拼起。
蓉儿让天明帮自己把盖聂骗出去,天黑之前回来就可以。天明按照蓉儿的指示,把盖聂带到林子里,并拿出竹简,装模作样的念出了一堆待办事项。盖聂看了一眼竹简,让天明等在原地,转眼的功夫就完成了所有事情。天明又把盖聂引到陷阱,将他吊在了网绳里面,借口找人帮忙,躲了起来。盖聂想办法脱出陷阱,找到了天明。天明见隐瞒不住,将蓉儿的安排说了出来。得知蓉儿不让自己回寨子,盖聂安静的在树下睡到了天黑。
盖聂与天明回到寨子,见到正在笨拙弹琴吟诗的蓉儿。