共58集
战国末期，荆轲刺秦失败牺牲。天下第一剑客盖聂受荆轲所托，护送荆轲之子荆天明躲避秦王追杀。在秦国边境残月谷，盖聂一人击退三百秦国铁骑，秦王震怒，命丞相李斯务必铲除两人。李斯在阴阳家东皇太一的指引下寻访到了盖聂的同门兄弟卫庄，卫庄剑术超群却始终居于盖聂之下，为夺得天下第一剑的名号，卫庄答应了李斯的要求，殊不知自己已经掉入了东皇太一的圈套。原来天明在出生之时，身上便被阴阳家偷偷种下“乾元玉煞”，“乾元玉煞”关系到一个巨大阴谋。逃亡路上，盖聂与天明结识了墨家众高手，以及楚国大将后人项少羽和墨家少女高月，一行人在命运的引领下进入被誉为世间最后一片净土的墨家机关城。机关城隐匿于绝岭雄峰之间，集结了墨家深厚的智慧，是天下所有反秦势力最后的堡垒，它也是墨家弟子最后的避难所。面对固若金汤的墨家机关城，赵高先用激将法又一次挑起卫庄的怨恨，继而又用权力诱惑卫庄，让他相信只要胡亥登基，卫庄就能拥有自己一直梦寐以求的权利与地位。为了攻破机关城，秦王派出庞大的精锐之师，卫庄找到了公输家族的掌门公输仇，公输仇与墨家世代为仇，机关城严密的防守工事受到了前所未有的挑战。卫庄刺客团中的数名高手亦纷纷出动，一时间，机关城内杀机迭起、暗流涌动。
少羽与天明率军攻入城阳，将士来报，说有部分秦兵负隅顽抗，少羽下令屠城。天明劝少羽收回命令，却被警告不要再对其下达的命令多言。天明不忍无辜百姓被杀，催动玉煞之力阻拦屠城的士兵，被盖聂拦住。
少羽和刘邦领兵南下，在雍丘之战中将李由斩杀。
赵高用酷刑逼李斯认罪，李斯说儿子李由会向胡亥证明他们父子的清白，却被告知李由已经战死，他们两个私通叛党的罪名已经坐实。李斯被罚俱五刑，夷三族；赵高检举彻查有功，接任丞相。
小植赶到镜湖医庄，拿出锦囊说是盖聂派自己来的。蓉儿以为盖聂请自己回去是为了赔罪，不等小植吃完饭，就拖着他往军营赶去。
少羽攻打陈留时遇到了连日阴雨，导致粮草迟迟不到，将士们吃不饱穿不暖。少羽为攻城之事烦恼，赤练送来了暖身的酒，并为他擦掉了脸上的雨水。赤练献计少羽，少羽找来天明，以兄弟情义相求，让他潜入陈留，向水井投毒。天明说因为少羽每过一地就大肆屠城，所以导致陈留百姓誓死反抗。天明的指责令少羽十分不快，说不用天明，要靠自己打下陈留。陈留依旧苦攻不下，少羽心中有气，对天明不理不睬。
项梁（武信君）大破章邯部队，设宴庆功。卫庄说现在还不到开怀畅饮的时候，建议一鼓作气拿下定陶，否则容易被章邯偷袭。项梁不听劝，卫庄借口不胜酒力，离开了宴席。
白凤将卫庄推回帐中，一边说他对不起赤练的一片痴心，一边对他百般折磨。白凤希望卫庄死掉，因为只有这样赤练才会断了念想。
项梁的部队沉浸在胜利的喜悦中疏于防守，章邯带领秦军趁机夜袭。卫庄听见动静，大喊通知部队有秦兵来袭。白凤本来打算离开卫庄，见己方军营火光四起，拨马回头赶去营救卫庄。卫庄行动不便，艰难的抵抗秦兵，千钧一发之际，白凤赶到。为了保护卫庄，白凤用身体挡住流箭，最终死去。临死前，白凤说自己做的一切都是为了赤练，让卫庄今后好好照顾她。项梁被章邯斩杀，项氏部队投降。
项梁的手下将定陶失守、项梁阵亡的消息报告给少羽，少羽骑马奔向定陶，天明和赤练也骑马追赶。三人遇到了项梁残余的部队，见到项梁的尸体，少羽仰天大哭说项梁的死都是因为天明当初不肯帮自己投毒。赤练见到白凤已死，在雨中失声痛哭。
赤练在白凤的坟前痛哭不止，卫庄却不知如何安慰。少羽在项梁的坟前说自己终于明白了王者霸道必须无情的原因，因为有情只会造成更大的牺牲。天明劝少羽不要偏激，少羽说自己不想再见到天明，让他离开。