共58集
战国末期，荆轲刺秦失败牺牲。天下第一剑客盖聂受荆轲所托，护送荆轲之子荆天明躲避秦王追杀。在秦国边境残月谷，盖聂一人击退三百秦国铁骑，秦王震怒，命丞相李斯务必铲除两人。李斯在阴阳家东皇太一的指引下寻访到了盖聂的同门兄弟卫庄，卫庄剑术超群却始终居于盖聂之下，为夺得天下第一剑的名号，卫庄答应了李斯的要求，殊不知自己已经掉入了东皇太一的圈套。原来天明在出生之时，身上便被阴阳家偷偷种下“乾元玉煞”，“乾元玉煞”关系到一个巨大阴谋。逃亡路上，盖聂与天明结识了墨家众高手，以及楚国大将后人项少羽和墨家少女高月，一行人在命运的引领下进入被誉为世间最后一片净土的墨家机关城。机关城隐匿于绝岭雄峰之间，集结了墨家深厚的智慧，是天下所有反秦势力最后的堡垒，它也是墨家弟子最后的避难所。面对固若金汤的墨家机关城，赵高先用激将法又一次挑起卫庄的怨恨，继而又用权力诱惑卫庄，让他相信只要胡亥登基，卫庄就能拥有自己一直梦寐以求的权利与地位。为了攻破机关城，秦王派出庞大的精锐之师，卫庄找到了公输家族的掌门公输仇，公输仇与墨家世代为仇，机关城严密的防守工事受到了前所未有的挑战。卫庄刺客团中的数名高手亦纷纷出动，一时间，机关城内杀机迭起、暗流涌动。
当年，小高从火海中救出了盖聂，却又被嬴政派来的杀手围攻，右腿受到重伤。此时正好墨家弟子赶到，将二人救出，送到了鬼谷子的隐居处。盖聂本名姬大仁，父亲姬明夷与鬼谷子是好友。鬼谷子向大仁道出七杀门被灭的背后主使就是嬴政，为了保护大仁，安慰老友的在天之灵，鬼谷子决定让大仁改换身份，收为自己的关门弟子。小高将大仁托付给鬼谷子后，独自回到江湖调查灭门的缘由。三年后鬼谷子仙逝，小高找到已经改名为盖聂的姬大仁，希望可以一起报仇，然后重建七杀门。盖聂却告诉小高，自己答应进入咸阳做内应，辅助荆轲刺杀秦王嬴政。隐隐感觉到盖聂是在逃避重建七杀门的小高，仍旧没有放弃重建七杀门，一直暗中做着努力。
面对小高的指责，盖聂讲出七杀门是在乱世中发展壮大起来的，如今秦王一统，天下太平，七杀门根本没有存在的必要。盖聂劝小高也忘掉重建七杀门的事情，好好的生活下去。小高告诉盖聂，七杀门就是自己的一切，他早就明白盖聂心中所想，不挑明只是为了给自己一个活下去的理由，自己无论如何都会杀掉鲍长老。雪女不忍小高再涉险，答应帮助他进入雁春君的府邸。
假算命的瞎子其实是卫庄的手下，人称易夫子。易夫子将卦摊开在妃雪阁对面，是为了更好的监视雪女和小高。雁春君收下了妃雪阁的拜帖后，雪女和小高一同前往雁府。两人来到雁府后，发现鲍长老已经被卫庄捉住。当年是鲍长老利用了卫庄，才导致掌门被杀，七杀门被灭。为了报仇，卫庄通过东皇太一（赵高），找到了化身为雁春君的鲍长老。将鲍长老杀死之后，卫庄决定杀掉当初只救走盖聂，却把自己留在火海中忍受绝望的小高。
盖聂在小高的肩膀上发现鸽子羽毛，推测卫庄也来到了洛阳。盖聂不放心小高，一直暗中跟随到了雁府，见小高和雪女有难，于是出手阻止卫庄。
将盖聂引到雁府，其实是卫庄的一石二鸟之计，另一边的易夫子已经偷偷潜到染坊，准备对被困住的天明等人下毒手了。