共58集
战国末期，荆轲刺秦失败牺牲。天下第一剑客盖聂受荆轲所托，护送荆轲之子荆天明躲避秦王追杀。在秦国边境残月谷，盖聂一人击退三百秦国铁骑，秦王震怒，命丞相李斯务必铲除两人。李斯在阴阳家东皇太一的指引下寻访到了盖聂的同门兄弟卫庄，卫庄剑术超群却始终居于盖聂之下，为夺得天下第一剑的名号，卫庄答应了李斯的要求，殊不知自己已经掉入了东皇太一的圈套。原来天明在出生之时，身上便被阴阳家偷偷种下“乾元玉煞”，“乾元玉煞”关系到一个巨大阴谋。逃亡路上，盖聂与天明结识了墨家众高手，以及楚国大将后人项少羽和墨家少女高月，一行人在命运的引领下进入被誉为世间最后一片净土的墨家机关城。机关城隐匿于绝岭雄峰之间，集结了墨家深厚的智慧，是天下所有反秦势力最后的堡垒，它也是墨家弟子最后的避难所。面对固若金汤的墨家机关城，赵高先用激将法又一次挑起卫庄的怨恨，继而又用权力诱惑卫庄，让他相信只要胡亥登基，卫庄就能拥有自己一直梦寐以求的权利与地位。为了攻破机关城，秦王派出庞大的精锐之师，卫庄找到了公输家族的掌门公输仇，公输仇与墨家世代为仇，机关城严密的防守工事受到了前所未有的挑战。卫庄刺客团中的数名高手亦纷纷出动，一时间，机关城内杀机迭起、暗流涌动。
天明和月儿发现转动的宝盒中有一封碧华留给月儿的信，信中交代了羲氏一族的两样秘宝，乾元玉煞和坤元玉珪。玉煞是一块蕴藏神秘力量的玉石，而玉珪却是一个人，玉珪是唯一可以制衡玉煞力量的法宝。玉煞和玉珪相生相克，并能感知彼此的存在。天明出生时，碧华感知到玉煞之力的苏醒。生下月儿后，发现玉珪的力量已经全部转移到了月儿身上。依照古籍的记载，只要通过仪式将玉珪杀掉献祭，玉煞的宿主就可以吸收所有的力量，强大到足以毁灭天地，而且他会丧失心智，成为仪式执行者的傀儡。为了保护月儿，碧华选择牺牲自己。
读过信后，月儿有些害怕，天明安慰她，两个人可以一起努力去改变命运，并承诺以后会一直陪伴和保护月儿。
扶苏快马加鞭赶回咸阳，禀报自己破掉了机关城，秦王大悦。赵高心中十分不快，要惩罚少司命。大司命禀报自己将少司命放走，前去捉拿玉珪。
月儿在江边见到父母相聚的幻象，痛苦有所减轻。一个黑衣人，悄悄靠近月儿，将其捉走。少羽找天明谈心，天明感知到月儿有危险，跑到河边，已不见月儿。盖聂带人四处寻找，发现月儿掉落在谷口的发簪，和一串通往谷外的马蹄印，推测月儿是被人抓走了。
天明要去阴阳家救月儿，被少羽劝住。盖聂告诉天明，月儿必须救，但是他也要有当巨子的觉悟，安排好墨家弟子。
众人围坐一起，商量接下来的去向，天明抱着宝盒独自坐在一边。锤哥建议转移到他大哥刘季（刘邦）驻扎的砀郡。盖聂与张良分析了芒砀山的地形，认为是个好去处，墨家首领也都一致同意前往。天明叫住了大家，说自己必须履行对先代巨子的承诺，一定要救出月儿，墨家弟子都表示理解。天明将宝剑交给更有领导能力的少羽，托付他帮自己暂时带领墨家，共同度过难关。
少司命没有抓到月儿，回到赵府遇到了大司命。大司命见其失败，催促她快走。正巧赵高回来，将二人都带回府中。得知少司命再次失败，赵高愤怒的击落了她头顶增强功力的混元珠，被大司命悄悄收起。赵高命令手下将少司命带走时，素影将月儿带回阴阳家。赵高大悦，计划将身上寄宿着玉煞的天明引回来。
猜到天明会一个人行动，盖聂和蓉儿决定陪他一起去救月儿。
赵高打算开启一部分玉珪之力，当天明体内的玉煞感应到玉珪的位置，就会自投罗网。玉珪之力开启之后，就会不停侵蚀本体的元气，令本体痛苦难耐。为了防止高月不听自己的驱使，赵高决定用碎魂迷心阵洗去月儿的意识，让她在无知觉的情况下承受玉珪之力。