共58集
战国末期，荆轲刺秦失败牺牲。天下第一剑客盖聂受荆轲所托，护送荆轲之子荆天明躲避秦王追杀。在秦国边境残月谷，盖聂一人击退三百秦国铁骑，秦王震怒，命丞相李斯务必铲除两人。李斯在阴阳家东皇太一的指引下寻访到了盖聂的同门兄弟卫庄，卫庄剑术超群却始终居于盖聂之下，为夺得天下第一剑的名号，卫庄答应了李斯的要求，殊不知自己已经掉入了东皇太一的圈套。原来天明在出生之时，身上便被阴阳家偷偷种下“乾元玉煞”，“乾元玉煞”关系到一个巨大阴谋。逃亡路上，盖聂与天明结识了墨家众高手，以及楚国大将后人项少羽和墨家少女高月，一行人在命运的引领下进入被誉为世间最后一片净土的墨家机关城。机关城隐匿于绝岭雄峰之间，集结了墨家深厚的智慧，是天下所有反秦势力最后的堡垒，它也是墨家弟子最后的避难所。面对固若金汤的墨家机关城，赵高先用激将法又一次挑起卫庄的怨恨，继而又用权力诱惑卫庄，让他相信只要胡亥登基，卫庄就能拥有自己一直梦寐以求的权利与地位。为了攻破机关城，秦王派出庞大的精锐之师，卫庄找到了公输家族的掌门公输仇，公输仇与墨家世代为仇，机关城严密的防守工事受到了前所未有的挑战。卫庄刺客团中的数名高手亦纷纷出动，一时间，机关城内杀机迭起、暗流涌动。
盖聂认为赵高陪秦王东巡祈福，咸阳城的羲氏一族正处在无主的状态，只要单独找到大司命或者月神并说服他们，救月儿的事情就会有转机。蓉儿还是不放心，盖聂交代天明遇到事情不要鲁莽冲动，要记着月儿在等着他回来。天明嘱咐盖聂等人帮自己瞒着月儿后，策马直奔咸阳。
东巡的路上，秦王身体一直不适，唤赵高给自己拿仙丹吃，并命令将服用次数提升为一日五次。
天明偷偷潜入赵高府中，四处探查下，发现了通往阴阳家的机关。守门的侍卫给素影（月神）送饭，天明跟踪后掰断门锁进入停棺室，见到素影正在用手扒饭吃。天明让素影告诉自己解救月儿的办法，却被精神失常的她当做碧华。见素影这条路行不通，天明踏上东巡之路，想要找到大司命。
蓉儿为月儿针灸，尽力延缓她的病情。
秦王由于大量服用仙丹，导致身体越来越差，预感自己命不久矣，写了一封诏书封入竹筒，命赵高八百里加急送往上郡。赵高当着秦王的面，念出诏书所写“命公子扶苏以兵属蒙恬，与丧会咸阳而葬”。见赵高行事忤逆秦王大怒，却发现自己突然失声。赵高假传旨意，命队伍全速返回咸阳，诏书由自己保管。秦王抽出藏于王座下的宝剑，想要斩杀赵高，最终体力不支倒地而亡。
蒙恬将盖聂与扶苏请到帐中，说收到赵高的信函，得知秦王正在返回咸阳,扶苏推测秦王病情严重。按照惯例，秦王应该发诏书让扶苏赶回咸阳，以备不测，可到现在什么动静都没有，蒙恬担心发生变故。扶苏要安排人手去探虚实，盖聂想要帮忙，被扶苏劝回。蒙恬告诉盖聂，扶苏从小就生活在对秦王的恐惧中，他们永远都无法体会到他的感觉。
天明一路上风餐露宿快马加鞭，终于找到了东巡的队伍，发现营地的附近有阵阵恶臭。天明假扮士兵，混进了队伍中，见到四处都在晾晒臭鱼。天明潜入大司命帐中，用剑逼迫他告诉自己救月儿的方法。大司命告诉天明，玉珪的力量一旦被开启，就不会被任何东西阻止，眼下玉珪只打开一部分，虽不足以唤醒玉煞之力，却会要了高月的命，自己也是无能为力。天明失神，将剑丢在地上。想着少司命如果还活着，应该不愿见到天明伤心，大司命说自己有办法让月儿多活一段时间。